| Arie Paulo Nogueira Neto | — | 431 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Japiim Pentecoste | — | 257 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Japiim Pentecostes | Acre | 257 km² |
 Área de Relevante Interesse Ecológico Javari Buriti | Santo Antônio do Içá | 132 km² |
| Arie Zona de Vida Silvestre da Apa da Ilha Comprida | Ilha Comprida | 126 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Corredor Ecológico Lagoa Encantada / Serra do Conduru | Ilhéus | 106 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Serra do Orobó | Itaberaba | 74,0 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Pontal da Serra da Ibiapaba | — | 61,3 km² |
 Área de Relevante Interesse Ecológico Manguezais da Foz do Rio Mamanguape | Rio Tinto | 57,7 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Morro Ferrabraz | Sapiranga | 57,6 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Serra da Abelha | Vitor Meireles | 50,2 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Nascentes do Rio de Contas | Abaíra | 47,7 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Nascente do Rio de Contas | Bahia | 47,6 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico da Lagoa do Portinho | Luís Correia | 37,3 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Projeto Dinâmica Biológica de Fragmentos Florestais | Rio Preto da Eva | 31,8 km² |
| Arie Parque Jk | Brasília | 29,9 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Parque Jk | distrito federal | 29,9 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Vale dos Buritis | — | 26,5 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológica Seringal Nova Esperança | Acre | 25,7 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Seringal Nova Esperança | — | 25,7 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Leopoldo Magno Coutinho | Agudos | 23,1 km² |
 Área de Relevante Interesse Ecológico Capetinga/Taquara | Park Way | 20,6 km² |
| Arie de Jardim Alegre | — | 16,9 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico dos Manguezais | Barra dos Coqueiros | 16,6 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Ipojuca-Merepe | Ipojuca | 14,7 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Cerrado Pé de Gigante | São Paulo | 12,0 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Cerrado Pé-de-gigante | — | 12,0 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico da Granja do Ipê | Brasília | 11,4 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico das Ilhas Cataguás | Angra dos Reis | 9,14 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico de Itapebussus | Rio das Ostras | 8,34 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Mata da Várzea | Recife | 7,96 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico da Pedra Branca | Tremembé | 6,36 km² |
| Arie de São Sebastião | Caraguatatuba | 6,08 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Dois Irmãos | Recife | 5,78 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Morro da Vargem | Ibiraçu | 5,74 km² |
| Arie I de Ramilândia | — | 5,65 km² |
| Arie Palmeiras de São José | — | 5,25 km² |
 Área de Relevante Interesse Ecológico do Morro do Iririú | Joinville | 4,98 km² |
| Arie Santuário de Vida Silvestre do Riacho Fundo | Brasília | 4,77 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Santuário de Vida Silvestre do Riacho Fundo | distrito federal | 4,77 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Orla Marítima | Recife | 4,63 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Guará | Ilha Comprida | 4,55 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Guará | São Paulo | 4,55 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Rio Vermelho | Rondonópolis | 4,32 km² |
 Área de Relevante Interesse Ecológico de São Sebastião | São Paulo | 4,28 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Matas do Curado | Recife | 4,11 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico das Águas Emendadas dos Inhamuns | Independência | 4,07 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Morro do Boa Vista | Joinville | 3,91 km² |