| Monumento Natural das Ilhas de Trindade e Martim Vaz e do Monte Colúmbia | — | 67.681 km² |
 Monumento Natural das Ilhas de Trindade, Martim Vaz e do Monte Columbia | Vitória | 67.680 km² |
| Monumento Natural do Arquipélago de São Pedro e São Paulo | Pernambuco | 47.192 km² |
| Monumento Natural das Árvores Fossilizadas do Estado do Tocantins | Filadélfia | 325 km² |
| Monumento Natural das Árvores Fossilizadas | Filadélfia | 292 km² |
 Monumento Natural Monólitos de Quixadá | Quixadá | 288 km² |
 Monumento Natural do Rio São Francisco | Canindé de São Francisco | 267 km² |
 Monumento Natural dos Pontões Capixabas | Águia Branca | 174 km² |
| Monumento Natural Estadual Serra das Torres | Muqui | 105 km² |
| Monumento Natural Estadual Mantiqueira Paulista | Piquete | 104 km² |
| Monumento Natural Estadual da Serra da Maria Comprida | Petrópolis | 78,0 km² |
| Monumento Natural Municipal Serra do Pantanal | Sonora | 41,6 km² |
| Monumento Natural Cavernas de Martins | Rio Grande do Norte | 35,4 km² |
| Monumento Natural Municipal da Serra do Soarinho | Cachoeiras de Macacu | 35,1 km² |
| Monumento Natural Municipal do Pico do Itaguaré | Cruzeiro | 33,3 km² |
 Monumento Natural Municipal Falésias de Marataízes | Marataízes | 33,3 km² |
 Monumento Natural Estadual da Pedra Grande | Mairiporã | 33,0 km² |
| Monumento Natural Estadual de Itatiaia | Ouro Branco | 32,2 km² |
| Monumento Natural Estadual de Santo Antônio | Matozinhos | 32,2 km² |
 Monumento Natural Estadual da Serra da Beleza | Valença | 31,6 km² |
| Monumento Natural do Pico do Frade | Macaé | 28,0 km² |
| Monumento Natural Estadual Serra da Moeda | Itabirito | 23,7 km² |
| Monumento Natural Estadual Serra da Piedade | Sabará | 19,5 km² |
| Monumento Natural Canyons e Corredeiras do Rio Sono | São Félix do Tocantins | 14,6 km² |
 Monumento Natural Municipal da Pedra do Elefante | Rio de Janeiro | 14,6 km² |
| Monumento Natural Municipal da Floresta | Itaperuna | 12,7 km² |
 Monumento Natural Municipal da Galheta | Florianópolis | 12,7 km² |
| Monumento Natural da Serra Vermelha | — | 11,7 km² |
| Monumento Natural da Serra da Ventania e Bandeira | Natividade | 11,5 km² |
| Monumento Natural Municipal Serra da Ferrugem | Conceição do Mato Dentro | 8,67 km² |
| Monumento Natural Municipal Serra do Bom Jardim | Alcinópolis | 8,67 km² |
 Monumento Natural O Frade e A Freira | Cachoeiro de Itapemirim | 8,54 km² |
 Monumento Natural Pedra do Cachorro | Brejo da Madre de Deus | 8,54 km² |
| Monumento Natural de Paraúna | — | 8,44 km² |
| Monumento Natural Municipal da Pedra Bonita | Santo Antônio de Pádua | 8,40 km² |
| Monumento Natural Municipal das Cachoeiras e Corredeiras do Rio Itabapoana | Bom Jesus do Itabapoana | 7,68 km² |
| Monumento Natural Municipal Curral de Pedras | — | 6,92 km² |
| Monumento Natural Estadual Serra dos Mascates | Valença | 6,75 km² |
| Monumento Natural Serra da Calçada | Nova Lima | 5,86 km² |
| Monumento Natural da Pedra do Elefante | Petrópolis | 5,30 km² |
 Monumento Natural das Ilhas Cagarras | Rio de Janeiro | 5,30 km² |
| Monumento Natural da Serra de Frecheiras | Rio de Janeiro | 4,57 km² |
| Monumento Natural Municipal da Serra de Frecheiras | — | 4,57 km² |
| Monumento Natural Municipal Pico do Cambote | Areal | 4,49 km² |
| Monumento Natural Estadual Serra do Gambá | Jeceaba | 4,42 km² |
 Monumento Natural Estadual Vargem da Pedra | Matozinhos | 4,42 km² |
| Monumento Natural Municipal da Serra da Prata | Santo Antônio de Pádua | 4,09 km² |
| Monumento Natural dos Canions do Subaé | Santo Amaro | 4,04 km² |