| Parque Estadual Marituba | Barra dos Coqueiros | 8.814 km² |
| Parque Estadual Sucunduri | Apuí | 7.962 km² |
| Parque Estadual Verde Grande | Minas Gerais | 7.962 km² |
| Parque Estadual de Mirador | Mirador | 7.668 km² |
 Parque Estadual Chandless | Santa Rosa do Purus | 6.930 km² |
| Parque Estadual Ambiental das Árvores Gigantes da Amazônia | — | 5.594 km² |
| Parque Estadual do Matupiri | Borba | 5.096 km² |
| Parque Estadual das Nascentes | Rorainópolis | 3.231 km² |
 Parque Estadual Serra do Mar | Paranapiacaba | 3.223 km² |
 Parque Estadual do Cocó | Maracanaú | 2.299 km² |
 Parque Estadual Igarapés do Juruena | Cotriguaçu | 2.238 km² |
| Parque Estadual de Guajará-Mirim | Rondônia | 2.050 km² |
| Parque Estadual de Montezuma | Montezuma | 2.050 km² |
 Parque Estadual do Jalapão | Mateiros | 1.590 km² |
 Parque Estadual Serra Ricardo Franco | Vila Bela da Santíssima Trindade | 1.569 km² |
| Parque Estadual Rio Negro Setor Norte | Novo Airão | 1.481 km² |
| Parque Estadual Serra Santa Bárbara | Porto Esperidião | 1.204 km² |
 Parque Estadual Encontro das Águas | Barão de Melgaço | 1.081 km² |
| Parque Estadual do Guirá | Cáceres | 1.046 km² |
 Parque Estadual do Cantão | Tocantins | 1.004 km² |
 Parque Estadual do Xingu | Santa Cruz do Xingu | 953 km² |
| Parque Estadual Ilha das Flores | Alta Floresta d'Oeste | 898 km² |
 Parque Estadual da Serra do Tabuleiro | Palhoça | 839 km² |
| Parque Estadual Tucumã | Colniza | 810 km² |
| Parque Estadual Rio Negro Setor Sul | Novo Airão | 780 km² |
| Parque Estadual do Pantanal do Rio Negro | Corumbá | 779 km² |
 Parque Estadual das Várzeas do Rio Ivinhema | Naviraí | 742 km² |
| Parque Estadual do Rio Turvo | Jacupiranga | 738 km² |
| Parque Estadual Guariba | Manicoré | 711 km² |
 Parque Estadual Charapucu | Afuá | 653 km² |
 Parque Estadual Cristalino | Novo Mundo | 590 km² |
 Parque Estadual dos Três Picos | Cachoeiras de Macacu | 588 km² |
 Parque Estadual de Terra Ronca | São Domingos | 570 km² |
 Parque Estadual do Morro do Chapéu | Morro do Chapéu | 519 km² |
| Parque Estadual Marinho Banco do Álvaro | Cururupu | 451 km² |
 Parque Estadual Marinho do Parcel de Manuel Luís | Cururupu | 451 km² |
 Parque Estadual Intervales | Ribeirão Grande | 429 km² |
 Parque Estadual Lagamar de Cananeia | Jacupiranga | 407 km² |
 Parque Estadual Caverna do Diabo | Eldorado | 402 km² |
 Parque Estadual Carlos Botelho | São Miguel Arcanjo | 401 km² |
| Parque Estadual do Rangel | Curimatá | 386 km² |
| Parque Estadual Cunhambebe | Mangaratiba | 381 km² |
 Parque Estadual do Morro do Diabo | Teodoro Sampaio | 366 km² |
| Parque Estadual Serra dos Reis | Costa Marques | 364 km² |
 Parque Estadual do Rio Doce | Marliéria | 359 km² |
 Parque Estadual Turístico do Alto Ribeira | Iporanga | 359 km² |
| Parque Estadual de Corumbiara | Cerejeiras | 353 km² |
| Parque Estadual Marinho Banco do Tarol | Cururupu | 342 km² |