| Parque Estadual Veredas do Peruaçu | Cônego Marinho | 312 km² |
| Parque Estadual Zé Bolo Flô | Cuiabá | 312 km² |
| Parque Estadual das Nascentes do Rio Taquari | Alcinópolis | 306 km² |
 Parque Estadual de Ilhabela | Ilhabela | 291 km² |
 Parque Estadual da Serra Dourada | Mossâmedes | 286 km² |
 Parque Estadual Grão Mogol | Grão Mogol | 284 km² |
| Parque Estadual das Lauráceas | Tunas do Paraná | 275 km² |
 Parque Estadual do Jurupará | Ibiúna | 262 km² |
| Parque Estadual da Serra do Papagaio | Aiuruoca | 259 km² |
| Parque Estadual do Verde Grande | — | 256 km² |
 Parque Estadual da Serra dos Martírios/Andorinhas | Pará | 250 km² |
 Parque Estadual da Ilha do Cardoso | Cananéia | 225 km² |
 Parque Estadual da Serra do Cabral | Joaquim Felício | 224 km² |
| Parque Estadual Nascentes do Paranapanema | Capão Bonito | 222 km² |
 Parque Estadual Caminho dos Gerais | Espinosa | 214 km² |
 Parque Estadual do Desengano | São Fidélis | 214 km² |
 Parque Estadual da Lagoa do Cajueiro | Matias Cardoso | 205 km² |
| Parque Estadual das Araucárias | São Domingos | 185 km² |
 Parque Estadual Serra Nova e Talhado | Mato Verde | 176 km² |
 Parque Estadual Biribiri | Diamantina | 170 km² |
 Parque Estadual do Turvo | Derrubadas | 165 km² |
| Parque Estadual Lagoa do Cajueiro | Januária | 159 km² |
| Parque Estadual da Lapa Grande "paulinho Ribeiro" | Montes Claros | 154 km² |
| Parque Estadual da Mata Seca | — | 154 km² |
| Parque Estadual Mata Seca | Minas Gerais | 154 km² |
| Parque Estadual de Itaberaba | Arujá | 151 km² |
 Parque Estadual Serra do Brigadeiro | Divino | 150 km² |
| Parque Estadual do Delta do Jacuí | Canoas | 142 km² |
 Parque Estadual Sete Salões | Resplendor | 137 km² |
| Parque Estadual Serra das Araras | Chapada Gaúcha | 136 km² |
| Parque Estadual Serra do Areal | Petrolina | 136 km² |
 Parque Estadual da Pedra Branca | Rio de Janeiro | 125 km² |
 Parque Estadual da Serra de Caldas Novas | Rio Quente | 122 km² |
 Parque Estadual da Ilha Grande | Angra dos Reis | 121 km² |
 Estação Ecológica Águas de Cuiabá | Rosário Oeste | 110 km² |
 Parque Estadual Serra Azul | Barra do Garças | 110 km² |
 Parque Estadual do Lajeado | Palmas | 108 km² |
 Parque Estadual de Itapetinga | Mairiporã | 102 km² |
 Parque Estadual do Camaquã | Camaquã | 102 km² |
| Parque Estadual das Carnaúbas | Granja | 100 km² |
| Parque Estadual das Trilhas | João Pessoa | 100 km² |
| Parque Estadual das Águas | Itaitinga | 98,4 km² |
 Parque Estadual Restinga de Bertioga | Bertioga | 92,7 km² |
 Parque Estadual da Serra do Conduru | Uruçuca | 91,5 km² |
 Parque Estadual do Aguapeí | Nova Independência | 90,5 km² |
| Parque Estadual da Lagoa do Açu | Campos dos Goytacazes | 82,5 km² |
 Parque Estadual de Campos do Jordão | Campos do Jordão | 82,0 km² |
 Parque Estadual da Pedra Selada | Resende | 80,4 km² |