 Parque Estadual da Ilha do Mel | Paranaguá | 0,75 km² |
 Parque Estadual de Ibiporã | Ibiporã | 0,74 km² |
| Parque Estadual do Pico Alto | — | 0,73 km² |
| Parque Estadual da Assessoria de Referência Agrária (ARA) | São Paulo | 0,67 km² |
| Parque Estadual da Ara | — | 0,64 km² |
 Parque Estadual Sumaúma | Manaus | 0,53 km² |
| Parque Estadual Alto do Cariri | Santa Maria do Salto | 0,50 km² |
| Parque Estadual da Mata do Krambeck | São Paulo | 0,50 km² |
 Parque Estadual Águas da Prata | Águas da Prata | 0,50 km² |
 Parque Estadual do Itinguçu | Peruíbe | 0,38 km² |
 Parque Estadual Serra do Intendente | Conceição do Mato Dentro | 0,33 km² |
| Parque Estadual do Cânion do Rio Poti | Buriti dos Montes | 0,25 km² |
 Parque Estadual Serra dos Martírios/Andorinhas | São Geraldo do Araguaia | 0,25 km² |
| Parque Estadual Massairo Okamura | Cuiabá | 0,12 km² |
| Parque Estadual do Descoberto | Goiás | 0,09 km² |
 Parque Estadual Águas do Paraíso | Alto Paraíso de Goiás | 0,06 km² |
| Parque Estadual João Paulo II | Curitiba | 0,05 km² |
| Parque Estadual do João Leite | Goiás | 0,03 km² |
 Núcleo Picinguaba | São Paulo | — |
 Núcleo Santana | — | — |
 Parque Estadual Candido Portinari | Alto de Pinheiros | — |
 Parque Estadual da Guarita | Rio Grande do Sul | — |
 Parque Estadual da Mina Velha | Ibaiti | — |
| Parque Estadual da Serra de Sonora | Mato Grosso do Sul | — |
 Parque Estadual de Jacupiranga | São Paulo | — |
 Parque Estadual de Parati Mirim | Paraty | — |
| Parque Estadual de Vila Rica do Espírito Santo | Fênix | — |
| Parque Estadual do Aratu | Paraíba | — |
 Parque Estadual do Caracol | Canela | — |
 Parque Estadual do Ibitipoca | Lima Duarte | — |
| Parque Estadual do Palmito | — | — |
| Parque Estadual Professor José Wachowicz | — | — |
| Parque Florestal Estadual de Nonoai | Nonoai | — |