| Parque Estadual de Botumirim | Botumirim | 5,71 km² |
 Parque Estadual de Campinhos | Tunas do Paraná | 5,67 km² |
 Parque Estadual Gruta da Lagoa Azul | Nobres | 5,28 km² |
 Parque Estadual dos Mananciais de Campos do Jordão | Campos do Jordão | 5,17 km² |
 Parque Estadual do Jaraguá | São Paulo | 4,93 km² |
 Parque Estadual da Costa do Sol | Araruama | 4,78 km² |
| Parque Estadual do Ibitiriá | Rio Grande do Sul | 4,15 km² |
| Parque Distrital Salto do Tororó | Brasília | 4,04 km² |
 Parque Estadual de Dois Irmãos | Recife | 3,87 km² |
 Parque Estadual do Cerrado | Sengés | 3,42 km² |
| Parque Estadual do Monge | — | 3,34 km² |
| Parque Estadual do Penhasco Verde | São Jerônimo da Serra | 3,05 km² |
| Parque Estadual de Ibicatu | Centenário do Sul | 3,04 km² |
| Parque Estadual Mata do Krambeck | — | 2,92 km² |
| Parque Estadual Mata da Pipa | Tibau do Sul | 2,91 km² |
| Parque Estadual Mata do Zumbi | Cabo de Santo Agostinho | 2,89 km² |
 Parque Estadual Marinho de Areia Vermelha | Cabedelo | 2,60 km² |
 Parque Estadual da Pedra da Boca | Araruna | 2,58 km² |
| Parque Estadual Caldeirão de Santa Cruz do Deserto | Crato | 2,28 km² |
 Parque Estadual da Fonte Grande | Vitória | 2,17 km² |
| Parque Estadual de Nova Baden | — | 2,15 km² |
 Parque Estadual Nova Baden | Minas Gerais | 2,14 km² |
| Parque Estadual de Amaporã | Amaporã | 2,09 km² |
| Parque Estadual Botânico do Ceará | Caucaia | 1,99 km² |
 Parque Estadual Águas da Billings | São Bernardo do Campo | 1,88 km² |
| Parque Estadual de Palmas | Palmas | 1,81 km² |
| Parque Estadual Mata do Xem-Xém | Bayeux | 1,79 km² |
 Parque Estadual Alberto Löfgren | São Paulo | 1,77 km² |
 Parque Estadual Matas do Segredo | Campo Grande | 1,77 km² |
| Parque Estadual Cachoeira da Fumaça | — | 1,62 km² |
 Parque Estadual da Cachoeira da Fumaça | Espírito Santo | 1,62 km² |
| Parque Estadual Vale do Códo | Sengés | 1,58 km² |
 Parque Estadual Paulo César Vinha | Guarapari | 1,57 km² |
| Parque Estadual Abaitará | Pimenta Bueno | 1,52 km² |
| Parque Estadual Sítio Fundão | Crato | 1,42 km² |
| Parque Estadual Mata de Duas Lagoas | Cabo de Santo Agostinho | 1,38 km² |
| Parque Estadual Mata do Pau Ferro | Areia | 1,38 km² |
| Parque Estadual Cerca Grande | Matozinhos | 1,34 km² |
| Parque Estadual Cristalino II | Novo Mundo | 1,34 km² |
 Parque Estadual do Prosa | Campo Grande | 1,33 km² |
| Parque Estadual do Rio da Onça | Matinhos | 1,31 km² |
 Parque Estadual do Sítio do Rangedor | São Luís | 1,21 km² |
| Parque Estadual Rio Preto | Minas Gerais | 1,11 km² |
| Parque Estadual Zoobotânico | Teresina | 1,09 km² |
| Parque Estadual da Baleia | Belo Horizonte | 1,07 km² |
 Parque Estadual Vitório Piassa | Pato Branco | 1,07 km² |
| Parque Estadual Mata da Pimenteira | Serra Talhada | 0,77 km² |
| Parque Estadual Mãe Bonifácia | Mato Grosso | 0,77 km² |