 Terra Indígena do Vale do Javari | terra indígena no Brasil | 85.445 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Amanã | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | 23.035 km² |
| Floresta Estadual de Tapauá | floresta estadual | 8.814 km² |
| Reserva Extrativista do Rio Unini | Reserva Extrativista | 8.497 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável do Juma | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | 5.808 km² |
| Reserva Extrativista Baixo Rio Branco Jauaperi | Reserva Extrativista | 5.806 km² |
| Floresta Nacional de Jatuarana | Floresta Nacional | 5.697 km² |
| Floresta Estadual Sucunduri | floresta estadual | 4.811 km² |
| Floresta Estadual Maúes | floresta estadual | 4.498 km² |
| Floresta Nacional de Mapiá-Inauiní | Floresta Nacional | 3.689 km² |
| Floresta Estadual Aripuanã | floresta estadual | 3.287 km² |
 Reserva Extrativista Médio Juruá | Reserva Extrativista | 2.870 km² |
| Floresta Nacional de Purus | Floresta Nacional | 2.561 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Rio Amapá | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | 2.143 km² |
| Floresta Estadual Apuí | floresta estadual | 1.828 km² |
| Reserva Extrativista Baixo Juruá | Reserva Extrativista | 1.780 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável do Matupiri | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | 1.770 km² |
| Floresta Estadual Manicoré | floresta estadual | 835 km² |
| Floresta Estadual Rio Urubu | floresta estadual | 271 km² |
 Reserva de Desenvolvimento Sustentável do Uatumã | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | 122 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ajuricana | Reserva Particular do Patrimônio Natural | 3,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Betel | Reserva Particular do Patrimônio Natural | 0,68 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Bela Vista | Reserva Particular do Patrimônio Natural | 0,63 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Nazaré das Lajes e Lajes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | 0,52 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Bela Vista - Am | Reserva Particular do Patrimônio Natural | 0,27 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva dos Arqueiros | Reserva Particular do Patrimônio Natural | 0,25 km² |
| Parque Municipal da Cacimba | parque natural municipal | 0,07 km² |
| Apuí State Forest | área protegida do Brasil | — |
| Arapixi Extractive Reserve | área protegida do Brasil | — |
| Central Amazon Biosphere Reserve | reserva da biosfera | — |
 Jardim Botânico Adolpho Ducke | área protegida do Brasil | — |
| Pau-Rosa National Forest | área protegida do Brasil | — |
| Puranga Conquista Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | — |
| Serra do Divisor National Park | reserva florestal | — |
| Sucunduri State Forest | área protegida do Brasil | — |
| Sucunduri State Park | área protegida do Brasil | — |
 Terra Indígena Tenharim do Igarapé Preto | terra indígena no Brasil | — |
| Terra Indígena Tenharim Marmelos | terra indígena no Brasil | — |
| Tupé Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | — |
 Uacari Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | — |
| Urariá Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | — |