| Floresta Estadual do Paru | Pará | 36.100 km² |
| Floresta Estadual do Trombetas | Pará | 31.436 km² |
| Floresta Estadual do Amapá | Amapá | 23.703 km² |
| Floresta Estadual de Tapauá | Amazonas | 8.814 km² |
| Floresta Estadual de Faro | Pará | 6.140 km² |
| Floresta Estadual Sucunduri | Amazonas | 4.811 km² |
| Floresta Estadual Maúes | Amazonas | 4.498 km² |
| Floresta Estadual de Iriri | Pará | 4.392 km² |
| Floresta Estadual Aripuanã | Amazonas | 3.287 km² |
| Floresta Estadual do Rio Gregório | Acre | 2.161 km² |
| Floresta Estadual Apuí | Amazonas | 1.828 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado do Rio Machado | Rondônia | 1.758 km² |
| Floresta Estadual Canutama | Canutama | 1.506 km² |
| Floresta Estadual do Mogno | Acre | 1.439 km² |
| Floresta Estadudal do Rio Liberdade | Acre | 1.264 km² |
| Floresta Estadual Manicoré | Amazonas | 835 km² |
| Floresta Estadual do Antimary | Acre | 576 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado do Rio Madeira "B" | Rondônia | 473 km² |
| Floresta Estadual do Rio Pardo | Rondônia | 308 km² |
| Floresta Estadual Rio Urubu | Amazonas | 271 km² |
| Floresta Estadual do Araguaia | Goiás | 223 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado Mutum | Rondônia | 112 km² |
| Floresta Estadual do Uaimii | Minas Gerais | 44,4 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado Rio Vermelho (C) | Rondônia | 41,0 km² |
| Floresta Estadual de Assis | São Paulo | 27,1 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado Cedro | Rondônia | 25,7 km² |
| Floresta Estadual Pederneiras | São Paulo | 19,4 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado Periquito | Rondônia | 11,5 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado Araras | Rondônia | 10,9 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado Tucano | Rondônia | 7,25 km² |
| Floresta Estadual do Palmito | Paraná | 5,35 km² |
| Floresta Estadual Metropolitana | Paraná | 4,59 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado Gavião | Rondônia | 4,56 km² |
| Floresta Estadual do Noroeste Paulista | São Paulo | 3,93 km² |
| Floresta Estadual do Passa Dois | Paraná | 2,53 km² |
| Floresta Estadual de Santana | Paraná | 2,39 km² |
| Floresta Estadual São Judas Tadeu | Minas Gerais | 1,41 km² |
| Floresta Estadual de Guarulhos | São Paulo | 0,92 km² |
| Floresta Estadual Serra D'água | São Paulo | 0,51 km² |
| Floresta Estadual Córrego da Biquinha | Paraná | 0,37 km² |
| Floresta Estadual José Zago | Rio de Janeiro | 0,29 km² |
 Horto Florestal Edmundo Navarro de Andrade | Rio Claro | — |