 Estação Ecológica de Águas Emendadas | Estação Ecológica | Planaltina | 91,8 km² |
| Estação Ecológica Jataí | Estação Ecológica | Luiz Antônio | 90 km² |
 Reserva Biológica das Perobas | Reserva Biológica | Paraná | 87,2 km² |
| Estação Ecológica Rio Flor do Prado | Estação Ecológica | Aripuanã | 85,4 km² |
 Estação Ecológica de Tamoios | Estação Ecológica | Paraty | 84,7 km² |
 Reserva Biológica União | Reserva Biológica | Casimiro de Abreu | 77,6 km² |
| Estação Ecológica Serra da Canoa | Estação Ecológica | Floresta | 76,0 km² |
| Estação Ecológica Chapada de Nova Roma | Estação Ecológica | Nova Roma | 69,3 km² |
 Estação Ecológica Mico-Leão-Preto | Estação Ecológica | São Paulo | 66,8 km² |
| Estação Ecológica da Mata Preta | Estação Ecológica | — | 65,7 km² |
 Estação Ecológica de Mata Preta | Estação Ecológica | Paraná | 65,7 km² |
| Estação Ecológica de Acauã | Estação Ecológica | Minas Gerais | 64,5 km² |
| Reserva Biológica Municipal da Mata do Bispo | Reserva Biológica | Itabira | 63,5 km² |
| Estação Ecológica de Murici | Estação Ecológica | Messias | 61,3 km² |
| Estação Ecológica Estadual Aratinga | Estação Ecológica | Itati | 60,4 km² |
 Reserva Biológica Estadual do Sassafras | Reserva Biológica | Benedito Novo | 50,7 km² |
| Reserva Biológica Jaíba | Reserva Biológica | Matias Cardoso | 50,7 km² |
 Reserva Biológica de Poço das Antas | Reserva Biológica | Silva Jardim | 50,6 km² |
| Estação Ecológica do Rio Preto | Estação Ecológica | Santa Rita de Cássia | 48,8 km² |
| Reserva Biológica da Serra Geral | Reserva Biológica | Maquiné | 48,5 km² |
| Reserva Biológica do Mato Grande | Reserva Biológica | Arroio Grande | 48,4 km² |
| Estação Ecológica do Jardim Botânico | Estação Ecológica | distrito federal | 45,0 km² |
| Reserva Biológica do São Donato | Reserva Biológica | Maçambará | 44,1 km² |
 Reserva Biológica de Pedra Talhada | Reserva Biológica | Correntes | 43,8 km² |
| Reserva Biológica Guaribas | Reserva Biológica | Rio Tinto | 40,5 km² |
| Reserva Biológica Serra Azul | Reserva Biológica | Jaíba | 38,4 km² |
| Reserva Biológica Traçadal | Reserva Biológica | Guajará-Mirim | 38,4 km² |
| Reserva Biológica de Araras | Reserva Biológica | São Paulo | 38,4 km² |
| Reserva Biológica Augusto Ruschi | Reserva Biológica | Santa Teresa | 35,6 km² |
| Reserva Biológica da Contagem | Reserva Biológica | Sobradinho | 34,1 km² |
 Estação Ecológica Estadual de Guaxindiba | Estação Ecológica | São Francisco de Itabapoana | 32,6 km² |
 Estação Ecológica de Santa Bárbara | Estação Ecológica | Águas de Santa Bárbara | 31,6 km² |
 Reserva Biológica Estadual da Praia do Sul | Reserva Biológica | Angra dos Reis | 31,4 km² |
 Reserva Biológica de Duas Bocas | Reserva Biológica | Viana | 30,9 km² |
 Estação Ecológica Veredas de Taquarussu | Estação Ecológica | Mato Grosso do Sul | 30,4 km² |
 Estação Ecológica de Xitué | patrimônio natural | São Paulo | 29,4 km² |
 Reserva Biológica Estadual de Guaratiba | Reserva Biológica | Rio de Janeiro | 28,8 km² |
| Estação Ecológica Chaúas | Estação Ecológica | Iguape | 27,0 km² |
 Estação Ecologica Bita e Utinga | Estação Ecológica | Ipojuca | 24,7 km² |
 Estação Ecológica Tupinambás | Estação Ecológica | São Sebastião | 24,6 km² |
| Estação Ecológica Wenceslau Guimarães | Estação Ecológica | Wenceslau Guimarães | 24,2 km² |
| Reserva Biológica do Córrego do Veado | Reserva Biológica | Pinheiros | 23,8 km² |
 Estação Ecológica da Ilha do Mel | patrimônio natural | Paraná | 23,2 km² |
 Reserva Biológica de Santa Isabel | Reserva Biológica | Pacatuba | 22,9 km² |
 Estação Ecológica dos Caetetus | Estação Ecológica | Gália | 22,2 km² |
 Estação Ecológica de Itirapina | Estação Ecológica | Itirapina | 22,1 km² |
| Reserva Biológica Rio Ouro Preto | Reserva Biológica | Guajará-Mirim | 20,7 km² |
 Estação Ecológica da Guanabara | Estação Ecológica | Guapimirim | 19,4 km² |