| Área de Proteção Ambiental do Manancial | Cordeiro | 0,31 km² |
| Apa das Pontas de Copacabana e Arpoador e Seus Entornos | Rio de Janeiro | 0,30 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Cachoeira da Fumaça | Bom Jesus do Itabapoana | 0,30 km² |
| Área de Proteção Ambiental Mata do Iguatemí | São Paulo | 0,30 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Serra de Itapipoca | Itapipoca | 0,29 km² |
| Área de Proteção Ambiental Posse/Guarita | Nova Iguaçu | 0,29 km² |
| Área de Proteção Ambiental Parque Municipal da Estância Ecológica do Cruzeiro | Mariana | 0,28 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Vale dos Buritis e Carnaubais | Pajeú do Piauí | 0,26 km² |
| Área de Proteção Ambiental Trizidela de Uso Sustentável | Codó | 0,26 km² |
| Apa da Paisagem e do Areal da Praia do Pontal | Rio de Janeiro | 0,24 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Paisagem e do Areal da Praia do Pontal | Rio de Janeiro | 0,24 km² |
| Área de Proteção Ambiental Moysés de Carvalho Alves | Anhanguera | 0,24 km² |
| Área de Proteção Ambiental Lago do Barro Vermelho | — | 0,18 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Cachoeira Santa Rosa | Bom Jesus do Itabapoana | 0,17 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Praia Mole | Serra | 0,16 km² |
| Área de Proteção Ambiental Prefeito João Mendes Olímpio | Teresina | 0,15 km² |
| Parque Zoobotânico de Ariquemes | Ariquemes | 0,14 km² |
| Área de Proteção Ambiental Parque Centenário de Balsas | Balsas | 0,13 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Recanto das Palmeiras | Cordeiro | 0,11 km² |
| Apa do Várzea Country Club | Rio de Janeiro | 0,10 km² |
 Área de Proteção Ambiental das Pontas de Copacabana e Arpoador e Seus Entornos | Rio de Janeiro | 0,10 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Várzea Country Club | Rio de Janeiro | 0,10 km² |
| Apa da Fazenda da Taquara | Rio de Janeiro | 0,09 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Fazenda da Taquara | Rio de Janeiro | 0,09 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal das Serras de Maricá | Maricá | 0,09 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal do Carmo | Queimados | 0,09 km² |
| Área de Proteção Ambiental - Horto Municipal Luiz Gonzaga de Macedo | Queimados | 0,08 km² |
| Apa Parque das Mangueiras | Porto Velho | 0,07 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Uso Sustentável, Sucupira | Timon | 0,07 km² |
| Área de Proteção Ambiental Ilha Verde | Mangaratiba | 0,07 km² |
 Área de Proteção Ambiental Parque Linear do Bindá | Manaus | 0,06 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Carmo | Itaubal | 0,05 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Morro do Calvário | — | 0,03 km² |
| Área de Proteção Ambiental Fonte da Nascente (nascenças) | — | 0,02 km² |
| Área de Proteção Ambiental Francisco Mendes | — | 0,01 km² |
| Área de Proteção Ambiental Grotão | — | 0,01 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Serrinha do Alambari | — | — |
 Área de Proteção Ambiental das Dunas do Rosado | Rio Grande do Norte | — |
| Área de Proteção Ambiental de Joanes-Ipitanga | Bahia | — |
| Área de Proteção Ambiental Floresta do Jacarandá | — | — |
| Área de Proteção Ambiental Gruta dos Brejões - Vereda do Romão Gramacho | — | — |
 Área de Proteção Ambiental Guapi-Guapiaçú | Rio de Janeiro | — |
| Área de Proteção Ambiental Maravilha | São José do Vale do Rio Preto | — |
| Área de Proteção Ambiental Municipal Vale da Avenida Assis Valente e do Parque em Rede Pedra de Xangô | Salvador | — |