| Parque Estadual Marinho Banco do Tarol | parque estadual | Cururupu | 342 km² |
 Parque Nacional da Chapada dos Guimarães | parque nacional | Cuiabá | 330 km² |
 Parque Nacional de Caparaó | parque nacional | Dores do Rio Preto | 318 km² |
 Parque Nacional da Serra do Cipó | parque nacional | Itambé do Mato Dentro | 316 km² |
 Parque Nacional da Serra do Gandarela | parque nacional | Itabirito | 313 km² |
| Parque Estadual Veredas do Peruaçu | parque estadual | Cônego Marinho | 312 km² |
| Parque Estadual Zé Bolo Flô | parque estadual | Cuiabá | 312 km² |
| Parque Estadual das Nascentes do Rio Taquari | parque estadual | Alcinópolis | 306 km² |
 Parque Estadual de Ilhabela | parque estadual | Ilhabela | 291 km² |
 Parque Estadual da Serra Dourada | parque estadual | Mossâmedes | 286 km² |
 Parque Estadual Grão Mogol | parque estadual | Grão Mogol | 284 km² |
| Parque Nacional de Itatiaia | parque nacional | — | 281 km² |
 Parque Nacional do Itatiaia | parque nacional | Rio de Janeiro | 281 km² |
| Parque Estadual das Lauráceas | parque estadual | Tunas do Paraná | 275 km² |
 Parque Nacional de Boa Nova | parque nacional | Dário Meira | 270 km² |
 Parque Estadual do Jurupará | parque estadual | Ibiúna | 262 km² |
| Parque Estadual do Verde Grande | parque estadual | — | 256 km² |
 Parque Estadual da Serra dos Martírios/Andorinhas | parque estadual | Pará | 250 km² |
 Parque Nacional de Saint-Hilaire/Lange | parque nacional | Morretes | 244 km² |
 Parque Estadual da Ilha do Cardoso | parque estadual | Cananéia | 225 km² |
 Parque Estadual da Serra do Cabral | parque estadual | Joaquim Felício | 224 km² |
| Parque Estadual Nascentes do Paranapanema | parque estadual | Capão Bonito | 222 km² |
| Parque Nacional e Histórico do Monte Pascoal | parque nacional | Porto Seguro | 222 km² |
 Parque Nacional dos Campos Gerais | parque nacional | Castro | 215 km² |
 Parque Estadual Caminho dos Gerais | parque estadual | Espinosa | 214 km² |
 Parque Estadual do Desengano | parque estadual | São Fidélis | 214 km² |
 Parque Nacional do Descobrimento | parque nacional | Prado | 211 km² |
 Parque Nacional do Alto Cariri | parque nacional | Guaratinga | 192 km² |
| Parque Nacional do Pau Brasil | parque nacional | — | 189 km² |
| Parque Estadual das Araucárias | parque estadual | São Domingos | 185 km² |
 Parque Estadual Serra Nova e Talhado | parque estadual | Mato Verde | 176 km² |
 Parque Nacional da Serra Geral | parque nacional | Praia Grande | 173 km² |
 Parque Estadual Biribiri | parque estadual | Diamantina | 170 km² |
 Parque Estadual do Turvo | parque estadual | Derrubadas | 165 km² |
| Parque Natural Municipal de Naviraí | parque natural | Naviraí | 162 km² |
 Parque Natural Municipal de Niterói | parque natural | Niterói | 162 km² |
| Parque Estadual Lagoa do Cajueiro | parque estadual | Januária | 159 km² |
| Parque Estadual da Lapa Grande "paulinho Ribeiro" | parque estadual | Montes Claros | 154 km² |
| Parque Estadual da Mata Seca | parque estadual | — | 154 km² |
| Parque Estadual Mata Seca | parque estadual | Minas Gerais | 154 km² |
| Parque Estadual de Itaberaba | parque estadual | Arujá | 151 km² |
 Parque Estadual Serra do Brigadeiro | parque estadual | Divino | 150 km² |
| Parque Nacional da Restinga de Jurubatiba | parque nacional | — | 149 km² |
 Parque Nacional Restinga de Jurubatiba | parque nacional | Rio de Janeiro | 149 km² |
| Parque Estadual do Delta do Jacuí | parque estadual | Canoas | 142 km² |
 Parque Estadual Sete Salões | parque estadual | Resplendor | 137 km² |
| Parque Estadual Serra das Araras | parque estadual | Chapada Gaúcha | 136 km² |
| Parque Estadual Serra do Areal | parque estadual | Petrolina | 136 km² |