| Área de Proteção Ambiental Águas da Serra | Área de Proteção Ambiental | — | 855 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serras da Caatinga | Área de Proteção Ambiental | — | 664 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Foz do Rio Doce | Área de Proteção Ambiental | Aracruz | 454 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável da Foz do Rio Aracatiaçu | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | — | 126 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Pontal da Serra da Ibiapaba | Área de Relevante Interesse Ecológico | — | 61,3 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Serra de Saudoso - São José | refúgio de vida silvestre | Paracambi | 60,9 km² |
| Terra Indígena Pakurity | terra indígena no Brasil | Cananéia | 57,3 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre do Soldadinho-do-araripe | refúgio de vida silvestre | Barbalha | 55,4 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serras de Irauçuba | Área de Proteção Ambiental | — | 49,7 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Vale dos Buritis | Área de Relevante Interesse Ecológico | — | 26,5 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Picos da Caatinga | refúgio de vida silvestre | — | 21,8 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Faxinal Bom Retiro | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Pinhão | 13,7 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Faxinal São Roquinho | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Pinhão | 12,1 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal do Morro da Boa Vista | Área de Proteção Ambiental | — | 10,1 km² |
| Monumento Natural de Paraúna | monumento natural | — | 8,44 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda União Gleba 01 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mansidão | 7,56 km² |
| Arie Palmeiras de São José | Área de Relevante Interesse Ecológico | — | 5,25 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Município de Santa Fé | Área de Proteção Ambiental | — | 4,72 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Maria Tereza Jorge Pádua | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Augusto de Lima | 3,54 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Entre Rios | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 3,06 km² |
| Arie Ouro Verde | Área de Relevante Interesse Ecológico | — | 2,93 km² |
| Parque Natural Municipal Sumidouro | parque natural municipal | — | 2,10 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Rio São Tomás | Área de Proteção Ambiental | — | 1,97 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Tuiuiu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Maracás | 1,75 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Terra Crua I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 1,74 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Campinas de Dentro - Gleba 1 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mansidão | 1,56 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Barreiras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 1,35 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal do Morro de Igarapiapunha | Área de Proteção Ambiental | — | 1,21 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal Nossa Senhora de Nazaré | Área de Proteção Ambiental | — | 1,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Barreiras Iii | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Canudos | 1,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural - Rppn Corredor Jennifer Mickelberg | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,98 km² |
| Parque Natural Municipal Águas do Araguaia | parque natural municipal | — | 0,66 km² |
| Monumento Natural Municipal da Ilha do Campeche | monumento natural | — | 0,63 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Morro do Macuco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,61 km² |
| Monumento Natural Furna dos Ossos | monumento natural | — | 0,60 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Litoral Norte | Área de Relevante Interesse Ecológico | Tramandaí | 0,51 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Ecológica Serra do Cabral | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Lassance | 0,45 km² |
| Monumento Natural Itacoatiaras do Ingá | monumento natural | — | 0,44 km² |
| Monumento Natural Municipal do Passo da Reserva | monumento natural | Reserva do Iguaçu | 0,33 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Sítio Amor Verdadeiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,33 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fruta do Lobo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bananal | 0,30 km² |
| Reserva Biológica (rebio) Mata dos Guanandis - Simflor Ii | Reserva Biológica | Itapoá | 0,28 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Vale dos Buritis e Carnaubais | Área de Proteção Ambiental | Pajeú do Piauí | 0,26 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Cooper A1 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Itapiranga | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lagoa Azul | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mundo dos Gigantes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Sítio Dunka Rosa | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,06 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Adélio Murakami | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Canelinha | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Inidavi | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Remanso do Rocio | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Petrópolis | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva do Pinhal - Gleba 5 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,02 km² |
| Área de Proteção Ambiental Fonte da Nascente (nascenças) | Área de Proteção Ambiental | — | 0,02 km² |
| Monumento Natural Cajueiro de Pirangi | monumento natural | — | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva do Pinhal - Gleba 10 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,01 km² |
| Área de Proteção Ambiental Francisco Mendes | Área de Proteção Ambiental | — | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual de Paulo Bernardo Schmitt & Amélia Schmitt | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0 km² |