| Santa Inês (terra indígena macuxi) | terra indígena no Brasil | — | — |
| Santa Maria Ecological Corridor | área protegida do Brasil | — | — |
| Santa Rosa do Purus National Forest | área protegida do Brasil | — | — |
| Santuario Ecológico de Pipa | reserva florestal | Rio Grande do Norte | — |
| Santuário dos Pajés | área protegida | Brasília | — |
 Santuário Ecológico de Pipa | reserva florestal | Tibau do Sul | — |
| Sauim-Castanheiras | área protegida do Brasil | Manaus | — |
| Seringueira Extractive Reserve | área protegida do Brasil | — | — |
| Serra da Cutia National Park | reserva florestal | Rondônia | — |
 Serra de São José | montanha | Minas Gerais | — |
 Serra do Barbosão | área protegida do Brasil | Rio de Janeiro | — |
| Serra do Divisor National Park | reserva florestal | Amazonas | — |
| Serra do Pardo | reserva florestal | Pará | — |
| Serra dos Parecis State Park | área protegida do Brasil | — | — |
| Serra dos Reis A State Park | área protegida do Brasil | Rondônia | — |
| Serra dos Reis State Park | área protegida do Brasil | Rondônia | — |
| South Amazon Ecological Corridor | área protegida do Brasil | — | — |
| South Amazon Ecotones Ecological Corridor | área protegida do Brasil | — | — |
| Southern Amazon Mosaic | área protegida do Brasil | — | — |
| Sucuba (terra indígena macuxi) | terra indígena no Brasil | — | — |
| Sucunduri State Forest | área protegida do Brasil | Amazonas | — |
| Sucunduri State Park | área protegida do Brasil | Amazonas | — |
| São Francisco National Forest | área protegida do Brasil | — | — |
| Sítio Arqueológico do Morro Santana | — | Mariana | — |
 Sítio Paleontológico Arroio Cancela | jazida paleontológica | — | — |
 Sítio Paleontológico Chiniquá | jazida paleontológica | Rio Grande do Sul | — |
| Sítio Paleontológico da Ilha da Fortaleza | jazida paleontológica | São João de Pirabas | — |
| Sítio Paleontológico de Itapecuru-Mirim | jazida paleontológica | Itapecuru-Mirim | — |
| Sítio Paleontológico de Água Negra | jazida paleontológica | São Martinho da Serra | — |
 Sítio Paleontológico Jazigo Cinco | jazida paleontológica | — | — |
| Sítio Paleontológico Largo Padre Daniel Cargnin | jazida paleontológica | Santa Maria | — |
| Sítio paleontológico Peirópolis e Serra da Galga | jazida paleontológica | — | — |
 Sítio Paleontológico Sanga da Alemoa | jazida paleontológica | — | — |
| Sítios Paleontológicos de Santa Maria | área protegida do Brasil | Santa Maria | — |