 Área de Proteção Ambiental Bacia do Rio de Janeiro | Área de Proteção Ambiental | Barreiras | 3.527 km² |
| Área de Proteção Ambiental Ponta da Baleia / Abrolhos | Área de Proteção Ambiental | Alcobaça | 3.455 km² |
 Área de Proteção Ambiental Marimbus / Iraquara | Área de Proteção Ambiental | Palmeiras | 1.249 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serra do Barbado | Área de Proteção Ambiental | Bahia | 680 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Serra do Barbado | Área de Proteção Ambiental | Rio de Contas | 637 km² |
 Área de Proteção Ambiental Costa de Itacaré/ Serra Grande | Área de Proteção Ambiental | Uruçuca | 626 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Litoral Sul | Área de Proteção Ambiental | Itaporanga d'Ajuda | 439 km² |
 Área de Proteção Ambiental Barra do Rio Mamanguape | Área de Proteção Ambiental | Paraíba | 149 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Barra do Rio Mamanguape | Área de Proteção Ambiental | — | 149 km² |
| Área de Proteção Ambiental Caraíva/ Trancoso | Área de Proteção Ambiental | Porto Seguro | 92,5 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Região Metropolitana de Belém | reserva florestal | Ananindeua | 75 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Serra de Maranguape | Área de Proteção Ambiental | Maranguape | 59,4 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Região Metrolpolitana de Belém | Área de Proteção Ambiental | Ananindeua | 56,5 km² |
 Parque Estadual Marinho da Laje de Santos | parque estadual | Santos | 51,4 km² |
| Área de Proteção Ambiental Coroa Vermelha | Área de Proteção Ambiental | Santa Cruz Cabrália | 33,3 km² |
 Área de Proteção Ambiental Rio Capivara | Área de Proteção Ambiental | Camaçari | 28,7 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Brilhante | Área de Proteção Ambiental | Itajaí | 20,1 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Nadir Júnior | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Moju | 20 km² |
 Parque Estadual do Juquery | parque estadual | Caieiras | 19,8 km² |
 Parque Estadual do Utinga | parque estadual | São Geraldo do Araguaia | 14,0 km² |
| Área de Proteção Ambiental Entorno Cicuta | Área de Proteção Ambiental | Volta Redonda | 8,96 km² |
 Área de Proteção Ambiental Lagoa Encantada | Área de Proteção Ambiental | Ilhéus | 8,81 km² |
 Parque Estadual Xixová-Japuí | parque estadual | Praia Grande | 6,64 km² |
| Estação Ecológica de Paranapanema | Estação Ecológica | Paranapanema | 6,35 km² |
| Parque Municipal Natural de Pimenta Bueno | parque natural municipal | — | 5,47 km² |
| Parque Natural Municipal de Pimenta Bueno | parque natural municipal | Rondônia | 5,47 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Monlevade | Reserva Particular do Patrimônio Natural | João Monlevade | 5,19 km² |
 Parque Estadual dos Mananciais de Campos do Jordão | parque estadual | Campos do Jordão | 5,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Bom Retiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 4,72 km² |
 Parque Natural Municipal Raimundo Gonçalez Malta | parque natural | Balneário Camboriú | 3,52 km² |
| Parque Natural Municipal da Serra do Mendanha | parque natural | Rio de Janeiro | 2,49 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Morro do Urubu | Área de Proteção Ambiental | Sergipe | 2,13 km² |
| Estação Ecológica do Noroeste Paulista | Estação Ecológica | Mirassol | 1,66 km² |
| Parque Natural Municipal Morro da Manteigueira | parque natural municipal | Espírito Santo | 1,61 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mercês Sabiaquaba e Nazário | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Amontada | 0,50 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Racho 55-I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Lagoa da Prata | 0,50 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pedra Amarilis | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Petrópolis | 0,40 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rancho 55-II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Lagoa da Prata | 0,39 km² |
| Área de Proteção Ambiental Mata do Iguatemí | Área de Proteção Ambiental | São Paulo | 0,30 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Córrego da Luz | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Ryan | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Itapevi | 0,19 km² |