| Bachia didactyla | Bachia | espécie ameaçada |
 Bacurau-do-são-francisco | Nyctiprogne | segura ou pouco preocupante |
 Bacurauzinho-da-caatinga | Nyctipolus | segura ou pouco preocupante |
| Badecla clarissa | Badecla | — |
| Banksolpium | Olpiidae | — |
| Baryancistrus hadrostomus | Baryancistrus | — |
| Baryancistrus micropunctatus | Baryancistrus | — |
 Baryancistrus niveatus | Baryancistrus | — |
 Baryancistrus xanthellus | Baryancistrus | Espécie quase ameaçada |
 Barycholos ternetzi | Barycholos | segura ou pouco preocupante |
| Bathysa mendoncaei | Bathysa | segura ou pouco preocupante |
| Batillipes brasiliensis | Batillipes | — |
| Batillipes dandarae | Batillipes | — |
| Batillipes potiguarensis | Batillipes | — |
| Begonia salesopolensis | Begonia | — |
| Bertolonia formosa | Bertolonia | — |
| Bertolonia foveolata | Bertolonia | — |
| Billbergia claudioi | Billbergia | — |
 Boana albomarginata | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
| Boana caiapo | Boana | — |
| Boana icamiaba | Boana | segura ou pouco preocupante |
 Boiruna sertaneja | Boiruna | segura ou pouco preocupante |
 Bokermannohyla | Hylinae | — |
 Bokermannohyla alvarengai | Bokermannohyla | segura ou pouco preocupante |
| Bokermannohyla astartea | Bokermannohyla | segura ou pouco preocupante |
| Bokermannohyla caramaschii | Bokermannohyla | segura ou pouco preocupante |
 Bokermannohyla circumdata | Bokermannohyla | segura ou pouco preocupante |
| Bokermannohyla claresignata | Bokermannohyla | espécie em perigo crítico |
| Bokermannohyla clepsydra | Bokermannohyla | espécie em perigo crítico |
| Bokermannohyla gouveai | Bokermannohyla | segura ou pouco preocupante |
 Bokermannohyla hylax | Bokermannohyla | segura ou pouco preocupante |
| Bokermannohyla ibitipoca | Bokermannohyla | segura ou pouco preocupante |
 Bokermannohyla pseudopseudis | Bokermannohyla | segura ou pouco preocupante |
| Bokermannohyla sapiranga | Bokermannohyla | — |
| Bonamia minima | Bonamia | — |
| Bothriurus asper | Bothriurus | — |
| Bothriurus illudens | Bothriurus | — |
 Bothriurus rochai | Bothriurus | — |
| Bothriurus rubescens | Bothriurus | — |
| Bothriurus signatus | Bothriurus | — |
 Bothrops erythromelas | Bothrops | segura ou pouco preocupante |
 Bothrops fonsecai | Bothrops | segura ou pouco preocupante |
 Bothrops itapetiningae | Bothrops | espécie vulnerável |
 Bothrops leucurus | Bothrops | segura ou pouco preocupante |
| Bothrops lutzi | Bothrops | segura ou pouco preocupante |
 Brachycephalus | Brachycephalidae | — |
 Brachycephalus ephippium | Brachycephalus | segura ou pouco preocupante |
 Brachycephalus hermogenesi | Brachycephalus | segura ou pouco preocupante |
| Brachycephalus ibitinga | Brachycephalus | — |
 Brachycephalus rotenbergae | Brachycephalus | — |
| Brachycephalus sulfuratus | Brachycephalus | — |
| Brachycephalus vertebralis | Brachycephalus | espécie ameaçada |
| Brachyhypopomus janeiroensis | Brachyhypopomus | segura ou pouco preocupante |
| Brasilionata arborense | Brasilionata | — |
 Brasiliscincus | Mabuyinae | — |
 Brasiliscincus agilis | Brasiliscincus | segura ou pouco preocupante |
| Brasiliscincus heathi | Brasiliscincus | segura ou pouco preocupante |
| Brasilotyphlus | Caeciliidae | — |
| Brasilotyphlus guarantanus | Brasilotyphlus | segura ou pouco preocupante |
| Brazilatemnus browni | Brazilatemnus | — |
| Breda flavostriata | Breda | — |
 Briba (género) | Hemidactylus | segura ou pouco preocupante |
| Brotheas amazonicus | Brotheas | — |
| Bulboctenus itunaitata | Bulboctenus | — |
| Bulboctenus kayapo | Bulboctenus | — |
| Bulboctenus munduruku | Bulboctenus | — |