| Vriesea repandostachys | Vriesea | — |
| Vriesea seideliana | Vriesea | — |
| Vulsor occidentalis | Vulsor | — |
| Wendilgarda nigra | Wendilgarda | — |
| Williamodendron cinnamomeum | Williamodendron | — |
| Wrightoporia araucariae | Wrightoporia | espécie em perigo crítico |
Wulfilopsis | Anyphaenidae | — |
| Wulfilopsis tenuipes | Wulfilopsis | — |
| Xenodon guentheri | Xenodon | segura ou pouco preocupante |
Xenohyla | Hylinae | — |
Xenohyla eugenioi | Xenohyla | segura ou pouco preocupante |
| Xyccarph | Oonopidae | — |
| Xylethrus perlatus | Xylethrus | — |
| Yacolla pikelinae | Yacolla | — |
| Yanguna erebus | Yanguna | — |
| Yanomamius franciscoi | Yanomamius | — |
| Yanomamius neblina | Yanomamius | — |
| Yanomamius raonii | Yanomamius | — |
Ybyrapora | Aviculariinae | — |
Ybyrapora sooretama | Ybyrapora | — |
Zachaenus | Cycloramphinae | — |
| Zachaenus carvalhoi | Zachaenus | segura ou pouco preocupante |
Zidedê-do-nordeste | Terenura | espécie em perigo crítico |
| Zollernia magnifica | Zollernia | espécie ameaçada |
| Zollernia modesta | Zollernia | — |
Zygopetalum crinitum | Zygopetalum | segura ou pouco preocupante |
| Zygopetalum viride | Zygopetalum | — |