 Reserva de Desenvolvimento Sustentável da Barra do Una | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Iguape | 24.219 km² |
 Cué-cué/Marabitanas Indigenous Territory | área protegida do Brasil | — | 8.090 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Rio Sucuriu- Paraíso | Área de Proteção Ambiental | — | 3.065 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre do Chaua | refúgio de vida silvestre | Cambuci | 675 km² |
 Área de Proteção Ambiental do Alto Iguaçu | Área de Proteção Ambiental | Duque de Caxias | 221 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Estadual Macaúbas | refúgio de vida silvestre | Minas Gerais | 111 km² |
| Área de Proteção Ambiental - Pedregulho | Área de Proteção Ambiental | Itu | 75,0 km² |
| Área de Proteção Ambiental - Apa da Perdição | Área de Proteção Ambiental | — | 61,3 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Perdição | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 61,3 km² |
| Área de Proteção Ambiental Rio do Colégio | Área de Proteção Ambiental | São Fidélis | 53,8 km² |
 Parque Estadual do Mendanha | parque estadual | Nova Iguaçu | 44,0 km² |
| Rds do Despraiado | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Iguape | 39,5 km² |
| Refúgio da Vida Silvestre do Despraiado | refúgio de vida silvestre | São Paulo | 39,5 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável do Despraiado | ecorregião | São Paulo | 39,5 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Itaipu | Reserva Extrativista | Niterói | 39,4 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Itaipu | Reserva Extrativista Marinha | Rio de Janeiro | 38,1 km² |
| Área de Proteção Ambiental Carapiá | Área de Proteção Ambiental | Quatis | 35,1 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Municipal de Barra Nova | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | — | 31,5 km² |
 Parque Natural Municipal do Tabuleiro | parque natural | Minas Gerais | 30,9 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Estadual de Macaúbas | refúgio de vida silvestre | Minas Gerais | 22,8 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santa Angélica | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio Brilhante | 20,9 km² |
 Parque Estadual do Prelado | parque estadual | Iguape | 18,3 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Serra da Bolívia | Área de Proteção Ambiental | Aperibé | 16,6 km² |
| Parque Natural Municipal das Águas de Guapimirim | parque natural municipal | Rio de Janeiro | 15,7 km² |
| Rds da Barra do Una | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Peruíbe | 14,9 km² |
| Refúgio da Vida Silvestre da Barra do Una | refúgio de vida silvestre | São Paulo | 14,9 km² |
 Parque Nacional Marinho das Ilhas dos Currais | parque nacional | Pontal do Paraná | 13,6 km² |
| Monumento Natural da Serra da Ventania e Bandeira | monumento natural | Natividade | 11,5 km² |
| Parque Natural Municipal da Mata Atlântica Aldeense | parque natural | São Pedro da Aldeia | 10,8 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Estadual Serra das Aroeiras | refúgio de vida silvestre | São José da Lapa | 10,4 km² |
 Parque Estadual do Forno Grande | parque estadual | Castelo | 9,13 km² |
| Parque Estadual Forno Grande | parque estadual | — | 9,13 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Bela Vista - Paraíso | refúgio de vida silvestre | Natividade | 7,88 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Pedra da Mina | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Queluz | 6,33 km² |
| Área de Proteção Ambiental Waldeir Gonçalves - Serra do Itaóca | Área de Proteção Ambiental | Campos dos Goytacazes | 6,17 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Saco de Coroa Grande | Área de Proteção Ambiental | Itaguaí | 5,95 km² |
| Área de Proteção Ambiental Monte Urubu | Área de Proteção Ambiental | Anchieta | 5,24 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre das Ilhas do Abrigo e Guararitama | Área de Proteção Ambiental | Peruíbe | 4,81 km² |
| Monumento Natural da Serra de Frecheiras | monumento natural | Rio de Janeiro | 4,57 km² |
| Monumento Natural Municipal da Serra de Frecheiras | monumento natural | — | 4,57 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Lagoa de Itapetinga | Área de Proteção Ambiental | Rio Grande do Sul | 4,37 km² |
 Área de Proteção Ambiental Baleia Sahy | Área de Proteção Ambiental | São Sebastião | 3,93 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Integra O Parque | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 3,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estância Mimosa | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bonito | 2,72 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pilar | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Maricá | 2,50 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Arizona | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Quixadá | 2,16 km² |
| Monumento Natural Muncipal Serra do Souza | monumento natural | — | 2 km² |
| Monumento Natural Municipal Serra do Souza | monumento natural | Minas Gerais | 2 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Luizinho Alencar | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Itatira | 2 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pioneira do Rio Piquiri | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Corumbá | 1,96 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Serra D'água | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Matriz de Camaragibe | 1,94 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Mariana | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Camamu | 1,87 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Corumbau I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Prado | 1,64 km² |
| Parque Natural Municipal Paisagem Carioca | parque natural | Rio de Janeiro | 1,60 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural da CSN | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 1,49 km² |
 Parque Natural Municipal do Morro da Cruz | parque natural municipal | Florianópolis | 1,30 km² |
| Monumento Natural da Água Santa | monumento natural | Natividade | 1,18 km² |
| Monumento Natural Muncipal Morro do Pires | monumento natural | — | 1,10 km² |
| Monumento Natural Municipal Morro do Pires | monumento natural | Minas Gerais | 1,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ponte da Pedra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 1,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ponte de Pedra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Goiás | 1,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Prata | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barreirinhas | 0,90 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Parque Botânico dos Kaiapós | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Senador Canedo | 0,81 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural São Bartolomeu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,71 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Catingueiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,60 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Lukavec | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Camamu | 0,58 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Maria Batista | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,48 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Canto da Araponga | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bom Retiro | 0,45 km² |
| Monumento Natural Municipal Morro do Elefante | monumento natural | Nova Lima | 0,44 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Rio das Furnas Ii | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alfredo Wagner | 0,44 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio das Furnas II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Catarina | 0,44 km² |
 Parque Estadual do Itinguçu | parque estadual | Peruíbe | 0,38 km² |
| Parque Natural Municipal Estoril - Virgílio Simionato | parque natural | São Bernardo do Campo | 0,38 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Ecológica Chefe Rosa | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Camamu | 0,38 km² |
 Área de Proteção Ambiental Paisagem Carioca | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 0,38 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Retiro das Vertentes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,37 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cícero Almeida | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Apuiarés | 0,36 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Canoa Vale dos Ipês | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cláudio | 0,35 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata do Confisco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,32 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Canto dos Pássaros | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Bohemia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Camamu | 0,27 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Picada | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Engenheiro Paulo de Frontin | 0,25 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rildo de Oliveira Gomes II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Teresópolis | 0,24 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio Vermelho | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 0,23 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santa Clara | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,21 km² |
| Reserva Particular de Patrimônio Natural Rancho Letty | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 0,19 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ilha Encantada | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ceará | 0,19 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rancho Letty | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,19 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Bianca | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Camamu | 0,19 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Minas Gerais | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Maria Madalena | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Palmares | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Maria de Jetibá | 0,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Grota do Sossego | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Paracambi | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vó Belar | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Meruoca | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Amplus Lucidus | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Águas Mornas | 0,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pedra Branca | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Águas Claras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Luiz do Paraitinga | 0,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva da Pedra Branca | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,12 km² |
| Parque Natural Municipal Olívio Osório Rodrigues | parque natural municipal | — | 0,10 km² |
| Parque Natural Municipal Jacuba | parque natural municipal | — | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mario e Alba Corral | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Macaé | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Parque do Zizo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Tapiraí | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Marina do Conde | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 0,08 km² |
| Rppn Marina do Conde | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Guarujá | 0,08 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fonte de Luz | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Meruoca | 0,07 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural O Bosque | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Gramado | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Mestre Bonina | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ilhéus | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Francisco Braz de Oliveira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ceará | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Natural Francisco Braz de Oliveira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,05 km² |
| Parque Natural Municipal Tancredo Neves - Passa Cinco | parque natural | Ponte Nova | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Linda Sofia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Teresa | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Maria Maria | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Saúde | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Olívio Daleprane | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Teresa | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva do Jacu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Canto dos Pássaros II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Teresópolis | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Dom Pedro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Teresa | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Grota da Serra 01 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Grota da Serra 03 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Meu Cantinho | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Teresa | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Bicho Preguiça | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Caldeirão | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,02 km² |
| Mata da Biologia da Universidade Federal de Viçosa | área protegida | Minas Gerais | — |