| Área de Proteção Ambiental do Boqueirão do Poti | Área de Proteção Ambiental | Poranga | 633 km² |
| Parque Estadual da Serra do Papagaio | parque estadual | Aiuruoca | 259 km² |
| Monumento Natural Estadual Mantiqueira Paulista | monumento natural | Piquete | 104 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Municipal Meiembipe | refúgio de vida silvestre | Florianópolis | 59,6 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Serra de Santo Amaro | Área de Proteção Ambiental | Guarujá | 54,2 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Serra Vermelha | Área de Proteção Ambiental | — | 48,0 km² |
| Parque Estadual do Cânion Cearense do Rio Poti | parque estadual | Poranga | 36,8 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Sertão Carioca | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 32,5 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Cabuçu Tanque Grande | Área de Proteção Ambiental | Guarulhos | 32,1 km² |
| Monumento Natural do Pico do Frade | monumento natural | Macaé | 28,0 km² |
| Área de Proteção Ambiental Corredores de Biodiversidade de Canela | Área de Proteção Ambiental | Canela | 26,9 km² |
| Área de Proteção Ambiental Águas Claras | Área de Proteção Ambiental | Petrolina de Goiás | 26,6 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre do Bicudinho | refúgio de vida silvestre | Guararema | 26,0 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Rio Maranguapinho | Área de Proteção Ambiental | Maracanaú | 17,8 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Chapadões | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Parnaíba | 17,5 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico dos Manguezais | Área de Relevante Interesse Ecológico | Barra dos Coqueiros | 16,6 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre da Lagoa do Taí | refúgio de vida silvestre | São João da Barra | 14,6 km² |
| Área de Proteção Ambiental Água Fria | Área de Proteção Ambiental | Amaralina | 13,3 km² |
| Monumento Natural da Serra Vermelha | monumento natural | — | 11,7 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serra da Arnica | Área de Proteção Ambiental | Varjão | 11,3 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Doutor Benedicto Júlio Valladares | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Jequitinhonha | 10,9 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Falcão | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Esplanada | 9,38 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Salgado | Área de Proteção Ambiental | São João da Barra | 9,10 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre do Ipê | refúgio de vida silvestre | Cardoso Moreira | 7,86 km² |
| Área de Proteção Ambiental Canal Campos Macaé | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 7,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rppn Quizanga | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Lourenço da Mata | 7,18 km² |
| Reserva Particular de Patrimônio Natural Quizanga | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Paudalho | 7,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Japurá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Esplanada | 5,34 km² |
| Estação Ecológica Municipal Alídio Moretti | Estação Ecológica | União da Vitória | 4 km² |
| Reserva Biológica Municipal Eduardo Sonnenstrahl | Reserva Biológica | União da Vitória | 3,64 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Caiapônia | Área de Proteção Ambiental | Caiapônia | 3,41 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Paraíso | refúgio de vida silvestre | — | 3,14 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Caldeirão | refúgio de vida silvestre | Italva | 3,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Mata Nativa | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 2,92 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Regua Iv | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 2,87 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre da Braúna | refúgio de vida silvestre | — | 2,77 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mutum de Alagoas II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Coruripe | 2,49 km² |
| Área de Proteção Ambiental Parque das Mangueiras | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 2,49 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Canto do Obrieni | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Caseara | 2,40 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre da Serra da Prata | refúgio de vida silvestre | — | 2,34 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Afrânio Menezes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Coruripe | 2,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Arival Antônio Zardo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Chapadão do Sul | 2,12 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Águas de Tucuns | Área de Proteção Ambiental | Armação dos Búzios | 1,92 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Guaíra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Caseara | 1,90 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre da Floresta do Camboatá | refúgio de vida silvestre | Rio de Janeiro | 1,72 km² |
| Área de Proteção Ambiental Córrego da Moranga | Área de Proteção Ambiental | Serranópolis | 1,55 km² |
| Área de Proteção Ambiental São Patrício | Área de Proteção Ambiental | São Patrício | 1,49 km² |
| Parque Natural Municipal Antônio Sansão Pacheco | parque natural municipal | — | 1,47 km² |
| Estação Ecológica Municipal Carlos Rogério Conrado Schmidt | Estação Ecológica | Pitanga | 1,22 km² |
| Área de Proteção Ambiental Novo Brasil | Área de Proteção Ambiental | Novo Brasil | 1,21 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Municipal do Morro do Lampião | refúgio de vida silvestre | Florianópolis | 1,11 km² |
| Parque Natural Municipal da Cultura Negra - Sítio da Candinha | parque natural municipal | São Paulo | 1,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pau D'arco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Jacobina | 1,07 km² |
| Parque Natural Municipal Volta Redonda | parque natural municipal | — | 1,03 km² |
| Monumento Natural Municipal da Concórdia | monumento natural | Guapimirim | 0,98 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Regua V | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Teresópolis | 0,98 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre da Garapa | refúgio de vida silvestre | Cardoso Moreira | 0,91 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio Estrela | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Magé | 0,84 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ninho da Tartaruga | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Tombos | 0,83 km² |
| Parque Natural Municipal José Mulato | parque natural municipal | Rio Grande do Norte | 0,82 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata do Gaitó | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barra do Piraí | 0,81 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mutum de Alagoas I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Coruripe | 0,75 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Rppn - Pedra D'antas Ii | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Lagoa dos Gatos | 0,73 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva da Serra da Piedade | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Caeté | 0,72 km² |
| Estação Ecológica do Tanque Grande | Estação Ecológica | Guarulhos | 0,70 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre da Ilha Chaú | refúgio de vida silvestre | São Paulo | 0,70 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cachoeira do Redondo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barreiras | 0,68 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cachoeira da Imbuia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | 1013 Tombecka | 0,67 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Cehab | Área de Proteção Ambiental | São João da Barra | 0,65 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio Almas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,62 km² |
| Monumento Natural Morro do Moreno | monumento natural | Vila Velha | 0,61 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Monsenhor Domingos Evangelista | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Caeté | 0,59 km² |
| Parque Natural Municipal das Dunas e Restingas de Tucuns | parque natural municipal | — | 0,56 km² |
| Área de Proteção Ambiental Castelandia | Área de Proteção Ambiental | Castelândia | 0,52 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Aquiraz Riviera | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ceará | 0,41 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Murundu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 0,41 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Bacupari | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,37 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Tendeiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Jacobina | 0,36 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Morro do Segredo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Tocantins | 0,33 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pedra Verde | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Jacobina | 0,32 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Barro Vermelho | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Varre-Sai | 0,31 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Jaguatirica | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Montezuma | 0,29 km² |
| Parque Natural Municipal Águas Claras | parque natural municipal | Goiás | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Flor das Águas do Cerrado | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio da Onça | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Jacobina | 0,27 km² |
| Parque Natural Municipal Manuel de Barros Pereira | parque natural municipal | Rio Grande do Sul | 0,23 km² |
| Parque Natural Municipal Morro José Lutzenberger | parque natural municipal | Rio Grande do Sul | 0,21 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Oliveira Amante | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barra Mansa | 0,19 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Campos Úmidos Vochysias | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Encontro das Águas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Paranaguá | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Frioeste | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bandeirante | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Boa Fé | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,18 km² |
| Parque Natural Municipal Izabel Dias Goulart | parque natural municipal | Rio Grande do Sul | 0,16 km² |
| Parque Natural Municipal Logemann | parque natural municipal | Rio Grande do Sul | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Águas da Manhana | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio São Joaquim I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Bento do Sapucaí | 0,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Unidade Avançada de Meio Ambiente Sítio Córrego Seco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São João del-Rei | 0,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Laje Bonita | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Goiás | 0,12 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Chácara São Miguel | Reserva Particular do Patrimônio Natural | 1013 Tombecka | 0,11 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Terra de Maria | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Goiás | 0,11 km² |
| Parque Natural Municipal Entre Trevos | parque natural municipal | Goiás | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Beira da Mata | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Buritis Águas Naturais | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santana do Cariri | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Domício Silva | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Água Branca | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Jacarandás | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Bica | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ceará | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sitio Talismã | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,08 km² |
| Parque Natural Municipal Horto Florestal | parque natural municipal | — | 0,07 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Riacho da Matinha | Área de Relevante Interesse Ecológico | Crato | 0,07 km² |
| Parque Natural Municipal Cachoeira de São Leandro | parque natural municipal | Rio de Janeiro | 0,06 km² |
| Parque Natural Municipal da Cascata do Salso | parque natural municipal | Rio Grande do Sul | 0,06 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pau Terra II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pirenópolis | 0,06 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural São Pedro do Campo Belo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio Novo | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Velho Moinho | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Varre-Sai | 0,05 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Carmo | Área de Proteção Ambiental | Itaubal | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pelegrini | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Varre-Sai | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Simplicidade | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pirenópolis | 0,04 km² |
| Monumento Natural Olho d’Água Monge João Maria de Jesus | monumento natural | Pitanga | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cachoeira do Juju | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Baependi | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural São Gerônimo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Maria Madalena | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Xodó Ii | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ametista | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Jacobina | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Biorregional | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mimosa | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Goiás | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Semente do Amor | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fizinho Dutra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Varre-Sai | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Luiz Jatobá Filho | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Goiás | 0,01 km² |