| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Xeriuini | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | — | 15.212 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Itapará - Boiaçu | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | — | 6.228 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Itã-Boiaçu | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Roraima | 6.228 km² |
| Parque Estadual das Nascentes | parque estadual | Rorainópolis | 3.231 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Campina | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Rorainópolis | 1.802 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Serra da Caiçara | Área de Proteção Ambiental | Alagoas | 1.033 km² |
| Área de Proteção Ambiental Berçários da Vida Marinha | Área de Proteção Ambiental | Icapuí | 132 km² |
| Parque Estadual das Águas | parque estadual | Itaitinga | 98,4 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Lagoas e Florestas de Niterói | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 86,9 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Salto do Suaçuí | Área de Proteção Ambiental | São Pedro do Suaçuí | 81,0 km² |
| Monumento Natural Estadual da Serra da Maria Comprida | monumento natural | Petrópolis | 78,0 km² |
| Refúgio da Vida Silvestre Nascentes do Sai | refúgio de vida silvestre | Rio de Janeiro | 67,0 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Lagoa da Ribeira | Área de Proteção Ambiental | Quissamã | 43,9 km² |
| Monumento Natural Cavernas de Martins | monumento natural | Rio Grande do Norte | 35,4 km² |
| Área de Proteção Ambiental Mesquita | Área de Proteção Ambiental | Mesquita | 27,1 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Serras de Inhoáiba, Cantagalo e Santa Eugênia | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 22,3 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serra da Onça | Área de Proteção Ambiental | Cardoso Moreira | 21,9 km² |
| Parque Natural Municipal dos Terraços Marinhos | parque natural municipal | — | 19,1 km² |
| Parque Natural Municipal de Mesquita | parque natural municipal | Rio de Janeiro | 18,9 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Nova Esperança | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Iramaia | 16,3 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Horto do Padre Cícero | Área de Proteção Ambiental | Juazeiro do Norte | 13,8 km² |
| Área de Proteção Ambiental dos Guaiamuns | Área de Proteção Ambiental | Itapoá | 12,4 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Avà-Canoeiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 10,2 km² |
| Monumento Natural Municipal das Cachoeiras e Corredeiras do Rio Itabapoana | monumento natural | Bom Jesus do Itabapoana | 7,68 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Lagoa da Precabura | Área de Proteção Ambiental | Fortaleza | 6,29 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Morro de Mutuapira | Área de Proteção Ambiental | Tanguá | 5,95 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Serra da Cacunda | refúgio de vida silvestre | Cardoso Moreira | 5,84 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre dos Campos de Sernambetiba | refúgio de vida silvestre | Rio de Janeiro | 5,57 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre dos Campos de Sernambitiba | refúgio de vida silvestre | Rio de Janeiro | 5,57 km² |
| Área de Proteção Ambiental dos Morros da Guanabara | Área de Proteção Ambiental | Niterói | 5,26 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Remy Ferreira Barros | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Flexeiras | 4,87 km² |
| Monumento Natural Municipal Pico do Cambote | monumento natural | Areal | 4,49 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Aliança | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Iramaia | 4,37 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre do Morro de Mutuapira | refúgio de vida silvestre | Tanguá | 3,81 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Edgard Navarro Sampaio | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Morro do Chapéu | 3,08 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Goiás Sul Parte a e Parte B | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 3 km² |
| Parque Estadual Mata do Krambeck | parque estadual | — | 2,92 km² |
| Monumento Natural Municipal Coredeiras e Piracemas do Rio Preto Mineiro | monumento natural | Belmiro Braga | 2,85 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Barro Branco | refúgio de vida silvestre | Italva | 2,60 km² |
| Parque Natural Municipal das Piasbas | parque natural municipal | Rio de Janeiro | 2,42 km² |
| Parque Estadual Caldeirão de Santa Cruz do Deserto | parque estadual | Crato | 2,28 km² |
| Parque Natural Municipal do Manguezal do Itacorubi - Fritz Müller | parque natural municipal | Santa Catarina | 2,12 km² |
| Refúgio da Vida Silvestre do Sucavão | refúgio de vida silvestre | Rio de Janeiro | 2,12 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lagoa da Velha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 2,07 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Córrego Palmital | refúgio de vida silvestre | Cardoso Moreira | 2,06 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Nelson Simões Costa I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Piaçabuçu | 2,02 km² |
| Monumento Natural Cárstico do Morro de Brejo do Amparo | monumento natural | Januária | 1,86 km² |
| Área de Proteção Ambiental dos Buritis | Área de Proteção Ambiental | Acreúna | 1,85 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Terra do Sol | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Serro | 1,72 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Floresta da Posse | Área de Relevante Interesse Ecológico | Rio de Janeiro | 1,72 km² |
| Arie Lagoa Azul | Área de Relevante Interesse Ecológico | Maragogi | 1,70 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre da Ilha do Canela | refúgio de vida silvestre | Amapá | 1,70 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Taguaíba II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Itanhaém | 1,68 km² |
| Parque Natural Municipal Maria Bonita | parque natural municipal | — | 1,58 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Pão-de-ló | refúgio de vida silvestre | Italva | 1,54 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre de Bulhões | refúgio de vida silvestre | Porto Real | 1,50 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Horto Alegria II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 1,42 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Fortaleza de Santa Cruz e dos Fortes do Pico e do Rio Branco | Área de Proteção Ambiental | Niterói | 1,41 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Klem | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Luisburgo | 1,39 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Refúgio Jamacaii | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Equador | 1,37 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Recanto do Arco-Íris (Novo) | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 1,26 km² |
| Parque Natural Municipal Salito João Fiorentin | parque natural municipal | Paraná | 1,16 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Ilha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Adrianópolis | 1,12 km² |
| Monumento Natural Morro do Cristo | monumento natural | Juiz de Fora | 1,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Edna Maria Tourinho Sampaio Navarro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Morro do Chapéu | 1,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Limeira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Uberaba | 1,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ferlag Resinas Brasil | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Nova Campina | 0,90 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico (arie) na Região da Gleba A. | Área de Relevante Interesse Ecológico | Rondonópolis | 0,87 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Horto Alegria Iii | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mariana | 0,84 km² |
| Parque Estadual do Pico Alto | parque estadual | — | 0,73 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Nelson Simões Costa II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Feliz Deserto | 0,73 km² |
| Parque Natural Municipal Floresta do Baldeador | parque natural municipal | Rio de Janeiro | 0,70 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Campo Alegre | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,66 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Girassol | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Itabira | 0,60 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vivendas de Taruaçu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São João Nepomuceno | 0,60 km² |
| Monumento Natural Estadual das Itans | monumento natural | Cajueiro da Praia | 0,58 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Asepi | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pirenópolis | 0,53 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sol e Luz | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,49 km² |
| Estação Ecológica da Serra dos Frios | Estação Ecológica | União dos Palmares | 0,48 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Engenho Fazenda Limoeiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Feira da Mata | 0,48 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio Claro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Jataí | 0,48 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural São Lourenço | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Avaré | 0,44 km² |
| Parque Natural Municipal da Colina do Conde | parque natural municipal | — | 0,33 km² |
| Parque Natural Municipal do Cerrado | parque natural municipal | — | 0,30 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Floresta Maria Helena | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cerqueira César | 0,30 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Kc | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Jucuruçu | 0,29 km² |
| Parque Natural Municipal Raimundo Tivotto Mascarello | parque natural municipal | Mato Grosso | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Juazeiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Irecê | 0,25 km² |
| Área de Proteção Ambiental Moysés de Carvalho Alves | Área de Proteção Ambiental | Anhanguera | 0,24 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Podestrela | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pedra do Anta | 0,23 km² |
| Monumento Natural Paleontológico Sanga da Alemoa | monumento natural | Santa Maria | 0,22 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Chapada dos Perdizes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Carrancas | 0,22 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Bem Viver | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pirenópolis | 0,21 km² |
| Parque Natural Municipal das Lagoas Claudia Mingorance Duram | parque natural municipal | — | 0,19 km² |
| Parque Natural Municipal Rio Garrafão | parque natural municipal | Pará | 0,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Tiê-Sangue | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Itacaré | 0,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Capitão da Mata | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Dona Augusta | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Joinville | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Pico da Bandeira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio do Sul | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva da Barra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barra de São Miguel | 0,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Recanto Olho D'Água | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 0,11 km² |
| Parque Natural Municipal das Lagoas Cláudia Mingorance Duram | parque natural municipal | Mato Grosso | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Butia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale das Copaíbas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Itutupã | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Anitápolis | 0,08 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Parque das Borboletas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | 1013 Tombecka | 0,08 km² |
| Apa Parque das Mangueiras | Área de Proteção Ambiental | Porto Velho | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Caiuá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata do Roque | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual ICAP - Industria e Comércio Catarinense de Pescados Ltda | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Belo | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Nelson Simões Costa III | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Feliz Deserto | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Parque Cachoeira do Açaí | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Piracema | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Trilhas do Cerrado | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Monte Alto | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pontões Bergezel | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mimoso do Sul | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Paleotoca Serra Laurentino | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Laurentino | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santuário Ecológico Mãe Terra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Brasília | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata Virgem | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Aruá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 0 km² |