 Área de Proteção Ambiental Ilha do Bananal/Cantão | Área de Proteção Ambiental | Dois Irmãos do Tocantins | 15.700 km² |
| Área de Proteção Ambiental Dunas e Veredas do Baixo Médio São Francisco | Área de Proteção Ambiental | Pilão Arcado | 10.249 km² |
 Área de Proteção Ambiental Ilhas e Várzeas do Rio Paraná | Área de Proteção Ambiental | Jateí | 10.052 km² |
 Área de Proteção Ambiental Chapada do Araripe | Área de Proteção Ambiental | Porteiras | 9.726 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável do Rio Iratapuru | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Laranjal do Jari | 5.808 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Costa dos Corais | Área de Proteção Ambiental | Porto de Pedras | 3.943 km² |
| Reserva Extrativista do Médio Juruá | Reserva Extrativista | — | 2.870 km² |
 Reserva Extrativista Médio Juruá | Reserva Extrativista | Amazonas | 2.870 km² |
 Área de Proteção Ambiental Fernão Dias | Área de Proteção Ambiental | Minas Gerais | 1.822 km² |
 Parque Estadual Serra Ricardo Franco | parque estadual | Vila Bela da Santíssima Trindade | 1.569 km² |
| Parque Estadual Serra Santa Bárbara | parque estadual | Porto Esperidião | 1.204 km² |
 Área de Proteção Ambiental de Muricí | Área de Proteção Ambiental | Colônia Leopoldina | 1.161 km² |
 Área de Proteção Ambiental Serra do Lajeado | Área de Proteção Ambiental | Tocantínia | 1.119 km² |
| Estação Ecológica do Rio Roosevelt | Estação Ecológica | Colniza | 980 km² |
| Área de Proteção Ambiental Lagoa de Itaparica | Área de Proteção Ambiental | Bahia | 781 km² |
 Parque Nacional de Ilha Grande | parque nacional | Naviraí | 761 km² |
| Floresta Estadual do Antimary | floresta etadual | — | 576 km² |
| Floresta Estadual do Antimary | floresta estadual | Acre | 576 km² |
 Área de Proteção Ambiental Rota do Sol | Área de Proteção Ambiental | Três Forquilhas | 524 km² |
| Reserva Extrativista Marinha do Arraial do Cabo | Reserva Extrativista | Cabo Frio | 518 km² |
 Reserva Extrativista Marinha Arraial do Cabo | Reserva Extrativista Marinha | Rio de Janeiro | 511 km² |
| Área de Proteção Ambiental Foz do Rio Santa Tereza | Área de Proteção Ambiental | Peixe | 501 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Lago de Pedra do Cavalo | Área de Proteção Ambiental | Cachoeira | 472 km² |
 Área de Proteção Ambiental de Guadalupe | Área de Proteção Ambiental | Sirinhaém | 439 km² |
 Área de Proteção Ambiental Serra Dona Francisca | Área de Proteção Ambiental | Joinville | 405 km² |
| Parque Estadual Serra dos Reis | parque estadual | Costa Marques | 364 km² |
| Área de Proteção Ambiental Urubuí | Área de Proteção Ambiental | Presidente Figueiredo | 356 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Estância Dorochê | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Poconé | 265 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Acurizal e Fazenda Penha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Corumbá | 263 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Estância Ecológica Sesc - Pantanal | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barão de Melgaço | 257 km² |
| Estação Ecológica do Rio Madeirinha | Estação Ecológica | Colniza | 137 km² |
 Parque Estadual da Serra do Conduru | parque estadual | Uruçuca | 91,5 km² |
| Estação Ecológica Estadual Aratinga | Estação Ecológica | Itati | 60,4 km² |
| Parque Estadual do Lago Azul | parque estadual | Luiziana | 44,9 km² |
 Parque Estadual Marinho da Pedra da Risca do Meio | parque estadual | Fortaleza | 37,2 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Parque Ecológico João Basso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rondonópolis | 36,2 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Cachoeira do Urubu | Área de Proteção Ambiental | Batalha | 30,6 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Engenheiro Passos APAEP | Área de Proteção Ambiental | Resende | 26,8 km² |
| Area de Proteção Ambiental Ribeirão D Laje | Área de Proteção Ambiental | — | 25,5 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Forte | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Terra Nova | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mato Grosso | 15,4 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Ilha do Combu | Área de Proteção Ambiental | Belém | 15,0 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Ecológica Maurício Dantas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Betânia | 14,8 km² |
 Área de Proteção Ambiental de São Bento | Área de Proteção Ambiental | Duque de Caxias | 7,66 km² |
| Parque Natural Municipal do Mico Leão Dourado | parque natural municipal | — | 7,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lote Cristalino | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alta Floresta | 6,70 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Seringal Assunção | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Velho | 6,23 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Boqueirão Pi | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Piauí | 5,80 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Boa Esperança | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Maranhão | 5,16 km² |
| Parque Natural Municipal do Aricanga Waldemar Devens | parque natural | Aracruz | 5,04 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal de Caratinga | Área de Proteção Ambiental | — | 4,24 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Ecológica do Panga | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Uberlândia | 4,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Primavera | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Tibagi | 4 km² |
| Apa Pedra Itaúna | Área de Proteção Ambiental | — | 3,67 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva do Jacob | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Nova Ponte | 3,58 km² |
 Área de Proteção Ambiental do Itapiracó | Área de Proteção Ambiental | São José de Ribamar | 3,55 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Jaquanêz | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Paraúna | 2,69 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Natural da Serra do Teimoso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 2 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Bom Jardim | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Matozinhos | 1,73 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda São Francisco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Maranhão | 1,50 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata da Califórnia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Salto da Divisa | 1,50 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Vereda do Gato | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cristalina | 1,43 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Granja São Roque - Reserva do Paredão | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Francisco de Assis | 1,40 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Cachoeira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Serra do Salitre | 1,22 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Salto Apepique | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ilhéus | 1,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Mata Funda | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 1,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estância Rivas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Presidente Figueiredo | 1 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Gana | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Tupaciguara | 0,93 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda do Lobo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Roque de Minas | 0,74 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva da Cachoeira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santana do Riacho | 0,72 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Pindorama - Go | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Goiás | 0,47 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Retiro Paraíso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Macapá | 0,47 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Chacrinha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Coração de Jesus | 0,34 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda do Sino | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Betim | 0,31 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Estrela da Serra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Olaria | 0,30 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Pithon | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Araçariguama | 0,26 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda São João | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ilhéus | 0,25 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Limeira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,19 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Tabatinga | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Goiana | 0,19 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rancho Mira-Serra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Francisco de Paula | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Cachoeira Grande | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 0,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Sannyasim | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Descoberto | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata da Cruz - Macuquinhos | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Conceição do Pará | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Pousada Serra Pitoco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ituporanga | 0,03 km² |
| Parque Natural Municipal do Distrito de Progresso | parque natural municipal | — | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Chakra Grisu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | distrito federal | 0,01 km² |
| Antimary State Forest | área protegida do Brasil | — | — |
| Rio Iratapuru Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | Amapá | — |
| Terra Indígena Paraná Boá-Boá | terra indígena no Brasil | Japurá | — |