| Parque Natural Municipal das Araras | parque natural municipal | Mato Grosso | 13.553.345 km² |
 Terra Indígena Alto Rio Negro | terra indígena no Brasil | — | 79.990 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Amanã | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Amazonas | 23.035 km² |
| Parque Nacional da Serra das Confusões | parque nacional | — | 8.238 km² |
| Parque Estadual Verde Grande | parque estadual | Minas Gerais | 7.962 km² |
| Floresta Nacional Altamira | Floresta Nacional | Pará | 7.255 km² |
| Floresta Nacional de Altamira | Floresta Nacional | — | 7.255 km² |
| Reserva Extrativista Tapajós-arapiuns | Reserva Extrativista | — | 6.773 km² |
 Reserva Extrativista Tapajós Arapiuns | Reserva Extrativista | Pará | 6.742 km² |
| Terra Indígena Zoé | terra indígena no Brasil | — | 6.690 km² |
| Floresta Nacional de Humaitá | Floresta Nacional | Humaitá | 4.732 km² |
 Área de Proteção Ambiental das Cabeceiras do Rio Cuiabá | Área de Proteção Ambiental | Nobres | 4.732 km² |
 Floresta Nacional de Itaituba II | Floresta Nacional | Itaituba | 3.978 km² |
 Floresta Nacional de Carajás | Floresta Nacional | Canaã dos Carajás | 3.913 km² |
| Área De Proteção Ambiental Dos Meandros Do Rio Araguaia | Área de Proteção Ambiental | Tocantins | 3.592 km² |
 Área de Proteção Ambiental Meandros do Araguaia | Área de Proteção Ambiental | Goiás | 3.592 km² |
 Parque Nacional Serra da Mocidade | parque nacional | Barcelos | 3.510 km² |
| Parque Nacional do Viruá | parque nacional | — | 2.810 km² |
 Parque Nacional Serra das Confusões | parque nacional | Piauí | 2.584 km² |
 Área de Proteção Ambiental Sistema Cantareira | Área de Proteção Ambiental | Piracaia | 2.541 km² |
 Parque Nacional Viruá | parque nacional | Roraima | 2.270 km² |
 Floresta Nacional de Itaituba I | Floresta Nacional | Itaituba | 2.131 km² |
| Floresta Nacional do Itacaiunas | Floresta Nacional | — | 1.398 km² |
| Floresta Nacional de Itacaiunas | Floresta Nacional | Pará | 1.367 km² |
 Área de Proteção Ambiental do Banhado Grande | Área de Proteção Ambiental | Gravataí | 1.045 km² |
| Estação Ecológica do Rio Ronuro | Estação Ecológica | Nova Ubiratã | 1.027 km² |
 Parque Estadual do Cantão | parque estadual | Tocantins | 1.004 km² |
 Área de Proteção Ambiental Itupararanga | Área de Proteção Ambiental | Votorantim | 936 km² |
| Área de Proteção Ambiental Pratigi | Área de Proteção Ambiental | Bahia | 934 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Pratigi | Área de Proteção Ambiental | — | 931 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serra do Sabonetal | Área de Proteção Ambiental | Jaíba | 854 km² |
| Área de Proteção Ambiental Estadual das Águas Vertentes | Área de Proteção Ambiental | — | 763 km² |
 Parque Estadual das Várzeas do Rio Ivinhema | parque estadual | Naviraí | 742 km² |
 Área de Proteção Ambiental Águas Vertentes | Área de Proteção Ambiental | Minas Gerais | 566 km² |
 Parque Estadual do Morro do Chapéu | parque estadual | Morro do Chapéu | 519 km² |
 Área de Proteção Ambiental Sapucaí Mirim | Área de Proteção Ambiental | Santo Antônio do Pinhal | 388 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Estância Ecológica Sesc - Pantanal | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barão de Melgaço | 384 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Serra Dourada | Área de Proteção Ambiental | Mossâmedes | 370 km² |
 Parque Estadual Grão Mogol | parque estadual | Grão Mogol | 284 km² |
| Parque Estadual do Verde Grande | parque estadual | — | 256 km² |
 Área de Proteção Ambiental do Rio Curiaú | Área de Proteção Ambiental | Macapá | 219 km² |
 Parque Estadual da Lagoa do Cajueiro | parque estadual | Matias Cardoso | 205 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Valo Fundo | Área de Proteção Ambiental | Santo Hipólito | 178 km² |
 Parque Estadual Biribiri | parque estadual | Diamantina | 170 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Poleiro Grande | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Corumbá | 165 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Praia de Ponta Grossa | Área de Proteção Ambiental | Icapuí | 161 km² |
| Parque Estadual Lagoa do Cajueiro | parque estadual | Januária | 159 km² |
| Parque Nacional da Restinga de Jurubatiba | parque nacional | — | 149 km² |
 Parque Nacional Restinga de Jurubatiba | parque nacional | Rio de Janeiro | 149 km² |
 Parque Estadual Sete Salões | parque estadual | Resplendor | 137 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Pratagy | Área de Proteção Ambiental | Rio Largo | 137 km² |
| Parque Estadual Serra das Araras | parque estadual | Chapada Gaúcha | 136 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Nova Era | Área de Proteção Ambiental | Nova Era | 115 km² |
| Área de Proteção Ambiental Lajedão | Área de Proteção Ambiental | Matias Cardoso | 112 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serra da Vargem Alegre | Área de Proteção Ambiental | Espera Feliz | 107 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Seringal Triunfo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ferreira Gomes | 100,0 km² |
 Parque Estadual do Aguapeí | parque estadual | Nova Independência | 90,5 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santa Cecília II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Corumbá | 89,8 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Alto Rio Turvo | Área de Proteção Ambiental | Campo Alegre | 82,5 km² |
 Reserva Biológica União | Reserva Biológica | Casimiro de Abreu | 77,6 km² |
| Área de Proteção Ambiental Alto Taboão | Área de Proteção Ambiental | Espera Feliz | 75,2 km² |
| Parque Estadual do Boguaçu | parque estadual | Paranaguá | 66,6 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Sirinhaém | Área de Proteção Ambiental | Rio Formoso | 65,9 km² |
 Parque Estadual Pico do Itambé | parque estadual | Serro | 65,2 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Serra da Aratanha | Área de Proteção Ambiental | Guaiúba | 64,5 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estação Veracel | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 60,7 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estação Veracel/Veracruz | patrimônio natural | Porto Seguro | 60,7 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Parque Ecológico Artex | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Blumenau | 53,0 km² |
| Parque Estadual Rio Corrente | parque estadual | Açucena | 51,8 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Campos de São Domingos | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 45,0 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Ressaca | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 40,5 km² |
 Área de Proteção Ambiental de Canoa-Quebrada | Área de Proteção Ambiental | Aracati | 40 km² |
| Reserva Biológica Serra Azul | Reserva Biológica | Jaíba | 38,4 km² |
| Parque Estadual Serra da Candonga | parque estadual | Guanhães | 33,3 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Área de Proteção do Reservatório de Juramento | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Juramento | 31,1 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Retiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Malhada | 30 km² |
 Parque Estadual da Serra de Jaraguá | parque estadual | Jaraguá | 28,3 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Santo Antonio do Pindaré,Gleba Barra da Jurema | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Açailândia | 21,5 km² |
 Parque Estadual Serra Negra | parque estadual | Itamarandiba | 17,1 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Boa Vista | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Malhada | 17 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Lagamar do Cauipe | Área de Proteção Ambiental | Caucaia | 16,9 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal da Lagoa Jacuném | Área de Proteção Ambiental | Serra | 13,3 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico da Granja do Ipê | Área de Relevante Interesse Ecológico | Brasília | 11,4 km² |
| Parque Natural Municipal de Nova Iguaçu | parque natural | Nova Iguaçu | 11 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Boca da Mata | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Aruanã | 10,6 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lagoa das Campinas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Palmas de Monte Alto | 10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata do Jambreiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 9,12 km² |
| Parque Natural Municipal do Pedroso | parque natural municipal | Santo André | 8,12 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Pindorama - Ba | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 6,36 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Bulcão | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 6,09 km² |
| Parque Natural Municipal Dom Luiz Gonzaga Fernandes | parque natural | Vitória | 5,84 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva do Caraguatá II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Antônio Carlos | 5,59 km² |
| Floresta Estadual do Palmito | floresta etadual | — | 5,35 km² |
| Floresta Estadual do Palmito | floresta estadual | Paraná | 5,35 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Boqueirão dos Frades | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Altos | 5,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Serrote | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 4,93 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Dunas do Litoral Oeste | Área de Proteção Ambiental | Paracuru | 4,36 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Pioneira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Marabá | 4 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Várzea | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Araruna | 3,91 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estância Santa Rita | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Vitória do Palmar | 3,40 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Tamanduá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Teresinha | 3,25 km² |
| Reserva Biológica Estadual Mata Paludosa | Reserva Biológica | Itati | 2,72 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Guilman Amorim | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 2,54 km² |
| Parque Estadual Botânico do Ceará | parque estadual | Caucaia | 1,99 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Santuário de Vida Silvestre Pousada das Araras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Serranópolis | 1,75 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico da Barra do Rio Camaratuba | Área de Relevante Interesse Ecológico | Mataraca | 1,68 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Fazenda Raposa | Área de Relevante Interesse Ecológico | Maracanaú | 1,37 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estação Biológica da Mata do Sossego | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Simonésia | 1,34 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Pecem | Área de Proteção Ambiental | Ceará | 1,22 km² |
| Parque Natural Municipal de Sertão | parque natural | Sertão | 1,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Araçari | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Itacaré | 1,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cachoeira Boa Vista | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cocalzinho de Goiás | 1,08 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Adão e Eva | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Presidente Figueiredo | 1 km² |
| Parque Natural Municipal do Ribeirão São José | parque natural | Itabira | 0,76 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Morro da Cruz das Almas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Paracatu | 0,73 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Santuário de Gabriel | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pirenópolis | 0,65 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Bela Vista | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Amazonas | 0,63 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Santuário | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Presidente Figueiredo | 0,60 km² |
| Reserva Biológica do Cerradão | Reserva Biológica | Brasília | 0,54 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Sítio Ecológico Monte Santo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Palmas | 0,53 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Pindorama | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,47 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vila Ana Angélica | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Antônio Dias | 0,46 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Retiro Boa Esperança | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Grande | 0,43 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santuário de Vida Silvestre Flor das Águas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pirenópolis | 0,43 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Sumidouro e Sítio Peito de Pomba | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Macaé | 0,43 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Floresta | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,31 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Santa Cristina | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Montanha | 0,29 km² |
 Monumento Natural Cachoeira do Ferro Doido | monumento natural | Morro do Chapéu | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mato Virgem do Lagradouro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Corinto | 0,25 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lote Urbano | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Amapá | 0,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda dos Cordeiros | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Luzia | 0,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Arte Verde | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva do Capão Grande | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barra do Ribeiro | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio São Francisco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Congonhas | 0,08 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Bosque de Canela | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Canela | 0,06 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Estrela Dalva | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cidade Ocidental | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Gleba O Saquinho de Itapirapuá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Angra dos Reis | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Jaguarema | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Maranhão | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Maria Francisca Guimarães | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Teresópolis | 0,01 km² |
| Terra Indígena Massaco | terra indígena no Brasil | Rondônia | — |