| Área de Proteção Ambiental Xeriuini | Área de Proteção Ambiental | Caracaraí | 16.717 km² |
 Área de Proteção Ambiental Baía de Todos os Santos | Área de Proteção Ambiental | Simões Filho | 1.246 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Bacia Hidrográfica do Rio Machado | Área de Proteção Ambiental | Congonhal | 1.174 km² |
| Reserva Extrativista do Lago do Cuniã | Reserva Extrativista | — | 764 km² |
 Reserva Extrativista Lago do Cuniã | Reserva Extrativista | Rondônia | 759 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal do Aricá-Açu | Área de Proteção Ambiental | Cuiabá | 754 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Joanes - Ipitanga | Área de Proteção Ambiental | — | 663 km² |
| Área de Proteção Ambiental Lago de Palmas | Área de Proteção Ambiental | Porto Nacional | 639 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Bacia Hidrográfica do Rio Uberaba | Área de Proteção Ambiental | Uberaba | 455 km² |
 Área de Proteção Ambiental Bonfim/Guaraíra | Área de Proteção Ambiental | Arez | 425 km² |
| Parque Estadual das Nascentes do Rio Taquari | parque estadual | Alcinópolis | 306 km² |
 Área de Proteção Ambiental de Santana do Paraíso | Área de Proteção Ambiental | Santana do Paraíso | 251 km² |
 Parque Nacional do Descobrimento | parque nacional | Prado | 211 km² |
| Parque Nacional do Pau Brasil | parque nacional | — | 189 km² |
 Parque Nacional Pau Brasil | parque nacional | Bahia | 115 km² |
 Floresta Nacional de Contendas do Sincorá | Floresta Nacional | Contendas do Sincorá | 112 km² |
 Floresta Nacional de Brasília | Floresta Nacional | Brasília | 93,4 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Santa Sofia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Aquidauana | 80,6 km² |
 Parque Nacional Cavernas do Peruaçu | parque nacional | Itacarambi | 44,4 km² |
 Área de Proteção Ambiental das Dunas de Paracuru | Área de Proteção Ambiental | Paracuru | 39,1 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Bica do Ipú | Área de Proteção Ambiental | Ipu | 34,7 km² |
 Área de Proteção Ambiental do Estuário do Rio Ceará - Rio Maranguapinho | Área de Proteção Ambiental | Ceará | 34,5 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Costa Dourada | Área de Proteção Ambiental | Mucuri | 33,5 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Estuário do Rio Ceará | Área de Proteção Ambiental | Caucaia | 27,4 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Lagoa do Uruaú | Área de Proteção Ambiental | Beberibe | 27,3 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológica Seringal Nova Esperança | Área de Relevante Interesse Ecológico | Acre | 25,7 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Seringal Nova Esperança | Área de Relevante Interesse Ecológico | — | 25,7 km² |
 Área de Proteção Ambiental do Estuário do Rio Mundaú | Área de Proteção Ambiental | Itapipoca | 13,6 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cara Preta | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 9,75 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Estuário do Rio Curu | Área de Proteção Ambiental | Paraipaba | 8,82 km² |
| Parque Natural Municipal Salão de Pedras | parque natural | Conceição do Mato Dentro | 8,58 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Serra do Cabral e Lazão | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 7,21 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda São Geraldo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bonito | 6,77 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Nhumirim | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Corumbá | 6,71 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Ingazeiras | Área de Proteção Ambiental | Paulistana | 6,54 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio dos Pilões | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Isabel | 5,60 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Dunas da Lagoinha | Área de Proteção Ambiental | Paraipaba | 4,98 km² |
| Apa da Serra da Capoeira Grande | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 4,79 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Serra da Capoeira Grande | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 4,79 km² |
| Apa da Lagoa de Itapeva | Área de Proteção Ambiental | Torres | 4,37 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Jurema | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 4,36 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Ecológica Sebuí | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Guaraqueçaba | 4,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Tibiriçá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Marabá | 4 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Usina Mauricio | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 3,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Não Me Deixes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Quixadá | 3 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Nascentes de Araguaina | Área de Proteção Ambiental | Araguaína | 2,99 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Cabeceira do Prata | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Jardim | 2,92 km² |
| Área de Proteção Ambiental Reserva Ecológica Vau Açu | Área de Proteção Ambiental | Ponte Nova | 2,77 km² |
 Parque Municipal de Mucugê | parque natural municipal | Mucugê | 2,70 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale do Corisco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Paraná | 2,54 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale do Corisco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 2,54 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Sucupira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 2,52 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal do Morro do Vilante | Área de Proteção Ambiental | Serra | 2,50 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santa Maria de Tapuã | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Piauí | 2,38 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Morro das Árvores | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 2,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Cruzeiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 1,80 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda São Geraldo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Valença | 1,73 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Pedra Dagua | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Solânea | 1,67 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Barra do Sana | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Macaé | 1,62 km² |
| Apa do Morro do Silvério | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 1,50 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Morro do Silvério | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 1,50 km² |
| Parque Natural Municipal da Prainha | parque natural | Rio de Janeiro | 1,47 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Centro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Buriti dos Lopes | 1,39 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda da Glória | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 1,29 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santuário Ecológico Sonhem | Reserva Particular do Patrimônio Natural | distrito federal | 1,26 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Jornalista Antenor Novaes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Engenheiro Paulo de Frontin | 1,25 km² |
 Parque Natural Municipal de São Roque - “Mata da Câmara” | parque natural | São Roque | 1,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural das Araucárias | Reserva Particular do Patrimônio Natural | General Carneiro | 1,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Bituri | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Belo Jardim | 1,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ilha do Caju | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Araioses | 1,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Curupira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio Grande do Sul | 1 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Água Branca | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Valença | 0,97 km² |
| Floresta Nacional de Ritápolis | Floresta Nacional | Ritápolis | 0,89 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Bela Aurora | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cruzeiro | 0,86 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Doutor Marcos Vidigal de Vasconcelos | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,84 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ecoparque de Una | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Una | 0,83 km² |
| Reserva Indígena Cachoeira dos Inácios | terra indígena no Brasil | Imaruí | 0,80 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Cachoeirinha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mangaratiba | 0,80 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Ecológica Metodista Ana Gonzaga - Cemag | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,73 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda do Iracambi | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rosário da Limeira | 0,70 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale das Antas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rondônia | 0,66 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Pontal da Barra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pelotas | 0,65 km² |
| Apa das Tabebuias | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 0,62 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Tabebuias | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 0,62 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Silvo Agro-Pastoril Gonçalves | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Tapiraí | 0,61 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Alto da Boa Vista | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,55 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ecoworld | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 0,51 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mariana Pimentel | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mariana Pimentel | 0,46 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Morro das Aranhas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Florianópolis | 0,44 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Pantanal | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Codó | 0,41 km² |
| Parque Natural Municipal Dr. Walquer Oliveira de Souza | parque natural | Miracema | 0,36 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mitra do Bispo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,35 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Horii | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Guapiara | 0,34 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Espora de Ouro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Luiz Gonzaga | 0,29 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Raio Solar | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Camanducaia | 0,29 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Arajara Park | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barbalha | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sitio Palmital | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Itápolis | 0,24 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Morro do Curussu Mirim | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ubatuba | 0,23 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural - Fazenda Barra do Pirapetinga | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,22 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Barra do Pirapetinga | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,22 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Suspiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Teresópolis | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural El Nagual | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Magé | 0,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Natural Menino Deus | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Florianópolis | 0,16 km² |
| Parque Natural Municipal Dr. Walquer Oliveira de Souza | parque natural municipal | Rio de Janeiro | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Minas do Paredão | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Piratini | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fonte da Bica | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Areia Branca | 0,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Ambiental de Educação e Pesquisa Banana Menina | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Hidrolândia | 0,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Barra do Rio do Meio | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Rosa de Lima | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Particular Professor Delmar Harry dos Reis | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Viamão | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Resgate I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Maria Velha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | distrito federal | 0,08 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Querência | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Magé | 0,06 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Sossego | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Uruçuca | 0,05 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Normando Tedesco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Balneário Camboriú | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Chacara Sananduva | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Viamão | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural João de Barro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Goiás | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Granja São Jorge | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ly e Cléo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Monte Sião | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Cerro das Acácias | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São João Nepomuceno | 0,01 km² |