 Parque Nacional Mapinguari | parque nacional | Porto Velho | 17.769 km² |
 Floresta Nacional do Iquiri | Floresta Nacional | Lábrea | 14.726 km² |
| Parque Estadual Marituba | parque estadual | Barra dos Coqueiros | 8.814 km² |
| Parque Nacional Nascentes do Lago Jari | parque nacional | Tapauá | 8.127 km² |
| Reserva Extrativista Ituxí | Reserva Extrativista | Lábrea | 7.763 km² |
| Reserva Extrativista do Médio Purús | Reserva Extrativista | Lábrea | 6.042 km² |
| Apa Marinha do Litoral Sul | Área de Proteção Ambiental | Cananéia | 3.684 km² |
 Reserva Extrativista Rio Xingu | Reserva Extrativista | São Félix do Xingu | 3.030 km² |
 Mosaico de Unidades de Conservação do Jacupiranga | patrimônio natural | São Paulo | 2.439 km² |
| Reserva Extrativista Ilha do Tumba | Reserva Extrativista | Cananéia | 1.377 km² |
 Reserva de Desenvolvimento Sustentável do Rio Negro | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Novo Airão | 1.030 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Quilombos de Barra do Turvo | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | São Paulo | 860 km² |
| Parque Estadual do Rio Turvo | parque estadual | Jacupiranga | 738 km² |
 Área de Proteção Ambiental Quilombos do Médio Ribeira | ecorregião | Barra do Turvo | 647 km² |
 Parque Estadual Lagamar de Cananeia | parque estadual | Jacupiranga | 407 km² |
 Parque Estadual Caverna do Diabo | parque estadual | Eldorado | 402 km² |
| Parque Estadual Cunhambebe | parque estadual | Mangaratiba | 381 km² |
| Área de Proteção Ambiental Alto Piraí - Apa Alto Piraí | Área de Proteção Ambiental | Rio Claro | 343 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serra da Meruoca | Área de Proteção Ambiental | Sobral | 294 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Santa Cruz | Área de Proteção Ambiental | Ilha de Itamaracá | 255 km² |
 Área de Proteção Ambiental Taruma/Ponta Negra | Área de Proteção Ambiental | Manaus | 226 km² |
| Estação Ecológica da Chapada da Serra Branca | Estação Ecológica | São Braz do Piauí | 216 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Natural Engenheiro Eliezer Batista | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Corumbá | 125 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vereda da Caraíba | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 104 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Aldeia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Chapada Gaúcha | 73,4 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Emilio Einsfeld Filho | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Capão Alto | 63,1 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável dos Quilombos de Barra do Turvo | Área de Proteção Ambiental | Barra do Turvo | 58,3 km² |
| Rds Quilombos de Barra do Turvo | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Barra do Turvo | 58,2 km² |
| Refúgio da Vida Silvestre Quilombos de Barra do Turvo | refúgio de vida silvestre | São Paulo | 58,2 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Serra do Palmital | Área de Proteção Ambiental | Caçapava | 57,7 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva do Triângulo I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 55,4 km² |
 Área de Proteção Ambiental Marinha do Litoral Norte | Área de Proteção Ambiental | São Paulo | 51,7 km² |
| Monumento Natural Municipal Serra do Pantanal | monumento natural | Sonora | 41,6 km² |
 Área de Proteção Ambiental Marinha do Litoral Centro | Área de Proteção Ambiental | São Paulo | 37,3 km² |
 Refúgio Estadual de Vida Silvestre Mata dos Muriquis | refúgio de vida silvestre | Santa Maria do Salto | 37,1 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Gibão/Fleixeiras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 35,3 km² |
 Monumento Natural Municipal Falésias de Marataízes | monumento natural | Marataízes | 33,3 km² |
| Rds Barreiro Anhemas | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Barra do Turvo | 32,7 km² |
| Refúgio da Vida Silvestre Barreiro Anhemas | refúgio de vida silvestre | São Paulo | 32,7 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Barreiro Anhemas | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | São Paulo | 32,7 km² |
| Área de Proteção Ambiental Rio Pardinho e Rio Vermelho | Área de Proteção Ambiental | Barra do Turvo | 32,3 km² |
 Área de Proteção Ambiental Cajati | Área de Proteção Ambiental | Cajati | 29,7 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale da Luciânia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 29,0 km² |
| Área de Proteção Ambiental Planalto do Turvo | Área de Proteção Ambiental | Barra do Turvo | 27,2 km² |
| Área de Proteção Ambiental Marinha do Litoral Sul | Área de Proteção Ambiental | São Paulo | 26,5 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mosquito | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Narandiba | 22,4 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Penedo | Área de Proteção Ambiental | Itatiaia | 22,2 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Capivary | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 19,8 km² |
| Reserva Extrativista Taquari | Reserva Extrativista | Cananéia | 16,6 km² |
| Rds dos Pinheirinhos | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Barra do Turvo | 15,3 km² |
| Refúgio da Vida Silvestre dos Pinheirinhos | refúgio de vida silvestre | São Paulo | 15,3 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável dos Pinheirinhos | ecorregião | São Paulo | 15,3 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Itapanhapima | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | São Paulo | 15,3 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Luiz Carlos Jurovsk Tamassia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 12,5 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável de Itapanhapima | área protegida do Brasil | Cananéia | 12,4 km² |
| Rds Itapanhapima | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Cananéia | 12,4 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Alegria | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mato Grosso do Sul | 11,4 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Horto Alegria | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 10,6 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santuário Veredas do São Miguel | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Unaí | 10,1 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável de Lavras | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Cajati | 8,90 km² |
| Refúgio da Vida Silvestre Lavras | refúgio de vida silvestre | São Paulo | 8,89 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Lavras | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | São Paulo | 8,89 km² |
| Rds Lavras | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Cajati | 8,87 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre da Mata da Represa | refúgio de vida silvestre | Caçapava | 8,71 km² |
| Arie de São Sebastião | Área de Relevante Interesse Ecológico | Caraguatatuba | 6,08 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Primavera I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Prado | 5 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Primavera | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Prado | 4,98 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Orla Marítima | Área de Relevante Interesse Ecológico | Recife | 4,63 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Guará | Área de Relevante Interesse Ecológico | Ilha Comprida | 4,55 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Guará | Área de Relevante Interesse Ecológico | São Paulo | 4,55 km² |
| Parque Municipal Natural Mata do Rio Uruguai Teixeira Soares | parque natural municipal | — | 4,28 km² |
 Área de Relevante Interesse Ecológico de São Sebastião | Área de Relevante Interesse Ecológico | São Paulo | 4,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio do Brasil II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 4,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Riacho das Pedras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Prado | 3,97 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Maria Vicentini Lopes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Belmonte | 3,92 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Serra do Papagaio - Matutu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Aiuruoca | 3,78 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio do Brasil III | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 3,57 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Sucury | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 2,80 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Bonsucesso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barra Mansa | 2,32 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cotovelo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 2,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Toca da Paca | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 1,87 km² |
| Rppn Toca da Paca | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Guatapará | 1,87 km² |
| Parque Natural Municipal Morada dos Corrêas | parque natural | Rio Bonito | 1,78 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santa Maria III | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Prado | 1,60 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santa Maria II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Prado | 1,59 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Leão da Montanha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Urubici | 1,54 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Duas Pedras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mato Grosso do Sul | 1,53 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Jataipeba | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Nilo Peçanha | 1,51 km² |
| Parque Estadual Sítio Fundão | parque estadual | Crato | 1,42 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Ponta do Araçá | Área de Proteção Ambiental | Porto Belo | 1,41 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda do Tanguá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 1,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Sambaiba | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio Claro | 1,18 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Mata do Posto Zootécnico | Área de Proteção Ambiental | Cordeiro | 1,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santa Maria I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Prado | 0,97 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio do Brasil I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 0,89 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rppn Contestado | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Maraial | 0,89 km² |
| Parque Natural Municipal Morro do Céu | parque natural | Criciúma | 0,84 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Jacuba Velha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 0,84 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rogério Marinho | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Petrópolis | 0,83 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Florestal Engenheiro João Furtado de Mendonça | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Natividade | 0,79 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Norikatsu Miyamoto | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Manaus | 0,77 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva São José | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ilhéus | 0,77 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Natural Sítio Palmeiras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Baturité | 0,76 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio do Brasil Iv | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 0,75 km² |
| Monumento Natural Municipal Arquelógico do Morro da Queimada | monumento natural | — | 0,67 km² |
| Parque Natural Municipal Arquelógico do Morro da Queimada | parque natural | Minas Gerais | 0,67 km² |
| Parque Natural Municipal Caixa D Água | parque natural | Rio Bonito | 0,64 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rabicho da Serra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 0,61 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Curucaca 4 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bom Retiro | 0,59 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Nossa Senhora Aparecida | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Duas Barras | 0,59 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Triângulo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Prado | 0,57 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Cruls | Área de Relevante Interesse Ecológico | distrito federal | 0,55 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Bom Sossego II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 0,54 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio do Brasil V | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 0,54 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Mato Grosso II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Saquarema | 0,53 km² |
| Parque Natural Municipal do Estuário do Rio Macaé | parque natural | Macaé | 0,50 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale do Sossego | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mendes | 0,48 km² |
 Parque Natural Municipal da Cidade | patrimônio natural | Rio de Janeiro | 0,47 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Jader Ferreira Ramos | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santana do Ipanema | 0,44 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Boa Esperança | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 0,40 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Sítio Grande | Área de Relevante Interesse Ecológico | Pernambuco | 0,38 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Serra do Caramandu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Sumidouro | 0,35 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Águas do Gigante | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Manaus | 0,35 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cachoeira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alagoas | 0,34 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda São Miguel | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Coromandel | 0,34 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Natural Serra da Pacavira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pacoti | 0,34 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Alto Rio Grande | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bocaina de Minas | 0,33 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale das Pedras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Catarina | 0,33 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Bons Amigos | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Manaus | 0,32 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Woodstock | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Nova Friburgo | 0,30 km² |
| Parque Natural Municipal Uirapuru | parque natural | Nova Lacerda | 0,25 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cachoeirinha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 0,24 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Córrego Floresta | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Afonso Cláudio | 0,24 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural São Carlos do Mato Dentro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Piraí | 0,24 km² |
| Parque Natural Municipal do Apertado | parque natural municipal | Rio Grande do Sul | 0,22 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Córrego Frio | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Nova Friburgo | 0,22 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Tocaia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santana do Ipanema | 0,22 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Campo Escoteiro Geraldo Hugo Nunes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Magé | 0,20 km² |
 Parque Natural Municipal da Caixa D´Água | parque natural | Duque de Caxias | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lençóis | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santa Fé | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Tanque d'Arca | 0,18 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural José Luiz Magalhães Netto | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio do Zaca | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Taquaral | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 0,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Jatobá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Piraí do Norte | 0,16 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Quero-Quero | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 0,16 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata da Serra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Espírito Santo | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Bello e Kerida | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Nova Friburgo | 0,14 km² |
| Parque Natural Municipal Verde Vale | parque natural | Rio Bonito | 0,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Águas Vertentes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio de Janeiro | 0,12 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cachoeira Alta | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Divino de São Lourenço | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Britagem São Salvador | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mahayana | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Nossa Senhora Aparecida | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bom Jardim | 0,09 km² |
| Rppn Mahayana | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mogi das Cruzes | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Alto da Boa Vista II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Descoberto | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Gotas Azuis | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Seropédica | 0,07 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Nossa Senhora Aparecida | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Sapucaia | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Fazenda São Miguel II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Coromandel | 0,06 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sao Judas Tadeu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Juquitiba | 0,06 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Soledade | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Nova Friburgo | 0,06 km² |
| Parque Natural Municipal do Alto Rio do Tanque | parque natural | Itabira | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cisne Branco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata da Copaíba | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,05 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Formigueiro-do-Litoral | Área de Relevante Interesse Ecológico | Saquarema | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Paraíso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mairiporã | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural do Bom Fim | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Espera Feliz | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santuário Rã-Bugio II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Guaramirim | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Santuário Rã-Bugio I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Guaramirim | 0,02 km² |
| Parque Natural Municipal da Pedra do Urubu | parque natural municipal | Rio de Janeiro | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Florindo Vidas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Iúna | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Águas do Caparaó | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Divino de São Lourenço | 0,01 km² |
| Parque Natural Municipal da Cultura Negra Sítio da Candinha | parque natural | Guarulhos | — |