 Gomesa microphyta | Gomesa | — |
 Gomesophis brasiliensis | Gomesophis | segura ou pouco preocupante |
| Gonatodes nascimentoi | Gonatodes | segura ou pouco preocupante |
 Gongora atropurpurea | Gongora | — |
| Gossypium mustelinum | Gossypium | espécie ameaçada |
 Grimpeirinho | Leptasthenura | segura ou pouco preocupante |
| Guadana manauara | Guadana | — |
| Guaraguaoonops | Oonopidae | — |
| Guaraguaoonops hemhem | Guaraguaoonops | — |
 Guariba-de-mãos-ruivas | Alouatta | espécie vulnerável |
| Guyruita atlantica | Guyruita | — |
 Guyruita cerrado | Guyruita | — |
 Gyalophylax hellmayri | Synallaxis | segura ou pouco preocupante |
| Gymnetis drogoni | Gymnetis | — |
 Gymnodactylus | Phyllodactylidae | — |
| Gymnodactylus amarali | Gymnodactylus | segura ou pouco preocupante |
 Gymnodactylus darwinii | Gymnodactylus | segura ou pouco preocupante |
 Gymnodactylus geckoides | Gymnodactylus | segura ou pouco preocupante |
| Gymnorhamphichthys petiti | Gymnorhamphichthys | — |
| Gymnorhamphichthys rosamariae | Gymnorhamphichthys | segura ou pouco preocupante |
 Haddadus | Craugastoridae | — |
| Haddadus binotatus | Haddadus | segura ou pouco preocupante |
| Harmonicon rufescens | Harmonicon | — |
| Heliconius astraea | Heliconius | — |
 Heliconius besckei | Heliconius | — |
 Heliconius nattereri | Heliconius | espécie em perigo crítico |
| Helicops modestus | Helicops | segura ou pouco preocupante |
| Helicops trivittatus | Helicops | segura ou pouco preocupante |
 Hemidactylus agrius | Hemidactylus | segura ou pouco preocupante |
| Henriettea saldanhaei | Henriettea | — |
| Hermachura leuderwaldti | Hermachura | — |
| Hetaerina dutati | Hetaerina | espécie em perigo crítico |
 Heterodactylus | Gymnophthalminae | — |
| Heterodactylus imbricatus | Heterodactylus | segura ou pouco preocupante |
| Heteropterys bahiensis | Heteropterys | — |
| Heteropterys capixaba | Heteropterys | — |
| Heteropterys megaptera | Heteropterys | — |
| Heteropterys oberdanii | Heteropterys | — |
| Heteropterys perplexa | Heteropterys | — |
 Hetschkia gracilis | Hetschkia | — |
| Hoffmannseggella munchowiana | Hoffmannseggella | — |
| Holoaden | Holoadeninae | — |
 Holoaden luederwaldti | Holoaden | Espécie quase ameaçada |
| Homoeomma nigrum | Homoeomma | — |
 Houlletia brocklehurstiana | Houlletia | — |
| Huberia espiritosantensis | Huberia | — |
| Humiriastrum spiritu-sancti | Humiriastrum | — |
 Huntleya meleagris | Huntleya | — |