| Huperzia biformis | Huperzia | — |
| Huperzia fontinaloides | Huperzia | — |
| Huperzia quadrifariata | Huperzia | — |
 Hylodes | Hylodidae | — |
 Hylodes asper | Hylodes | segura ou pouco preocupante |
| Hylodes babax | Hylodes | Espécie quase ameaçada |
| Hylodes cardosoi | Hylodes | segura ou pouco preocupante |
 Hylodes heyeri | Hylodes | segura ou pouco preocupante |
| Hylodes lateristrigatus | Hylodes | segura ou pouco preocupante |
| Hylodes magalhaesi | Hylodes | espécie ameaçada |
 Hylodes nasus | Hylodes | segura ou pouco preocupante |
| Hylodes regius | Hylodes | espécie em perigo crítico |
 Hylodes sazima | Hylodes | espécie vulnerável |
 Hylomantis | phyllomedusinae | — |
 Hylopezus ochroleucus | Hylopezus | segura ou pouco preocupante |
| Hypolytrum paraense | Hypolytrum | — |
| Hypothyris daphnis | Hypothyris | — |
| Hypsiboas bandeirantes | Hypsiboas | — |
 Hypsiboas bischoffi | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas buriti | Hypsiboas | espécie ameaçada |
 Hypsiboas exastis | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas goianus | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas guentheri | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas leptolineatus | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
| Hypsiboas leucocheilus | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas lundii | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas marginatus | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas paranaiba | Hypsiboas | — |
 Hypsiboas pardalis | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas polytaenius | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas pombali | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas prasinus | Hypsiboas | — |
 Hypsiboas semiguttatus | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
 Hypsiboas semilineatus | Hypsiboas | segura ou pouco preocupante |
| Hyptidendron asperrimum | Hyptidendron | segura ou pouco preocupante |
| Ibotyporanga | Pholcidae | — |
 Idiops camelus | Idiops | — |
 Idiops fuscus | Idiops | — |
 Idiops germaini | Idiops | — |
 Idiops petiti | Idiops | — |
 Idiops pirassununguensis | Idiops | — |
 Idiops rastratus | Idiops | — |
| Idiops santaremius | Idiops | — |
 Idiops siolii | Idiops | — |
 Ilargus coccineus | Ilargus | — |
| Indiani gaspar | Indiani | — |
| Ipomoea cavalcantei | Ipomoea | — |
 Iridopelma | Terafosídeos | — |