| Pycnothele perdita | Pycnothele | — |
| Pyrausta julialis | Pyrausta | — |
 Rabo-mole-da-serra | Embernagra | segura ou pouco preocupante |
| Radulphius | Cheiracanthiidae | — |
 Ramphodon naevius | Ramphodon | segura ou pouco preocupante |
| Retiro maculatus | Retiro | — |
| Rhamphichthys atlanticus | Rhamphichthys | dados insuficientes |
| Rhamphichthys drepanium | Rhamphichthys | segura ou pouco preocupante |
| Rhinatrema ron | Rhinatrema | — |
 Rhinella abei | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
 Rhinella cerradensis | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
 Rhinella crucifer | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
 Rhinella granulosa | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
| Rhinella henseli | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
| Rhinella inopina | Rhinella | — |
 Rhinella jimi | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
| Rhinella ocellata | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
 Rhinella ornata | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
| Rhinella paraguayensis | Rhinella | — |
| Rhinella pygmaea | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
 Rhinella rubescens | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
 Rhinella veredas | Rhinella | segura ou pouco preocupante |
 Rhipsalis oblonga | Rhipsalis | espécie vulnerável |
 Rhipsalis paradoxa | Rhipsalis | segura ou pouco preocupante |
 Rhipsalis pilocarpa | Rhipsalis | espécie vulnerável |
| Rhopalurus acromelas | Rhopalurus | — |
| Rhopalurus agamemnon | Rhopalurus | — |
 Rhopalurus rochai | Rhopalurus | — |
| Rhynchocyrtus klausi | Rhynchocyrtus | — |
| Riodocea pulcherrima | Riodocea | — |
| Rodriguesophis | Dipsadinae | — |
| Rodriguesophis iglesiasi | Rodriguesophis | segura ou pouco preocupante |
 Rodriguezia obtusifolia | Rodriguezia | — |
| Rodrigueziopsis microphyta | Rodrigueziopsis | — |
| Rokautskyia pseudoglazioui | Rokautskyia | — |
| Rondonops | Gymnophthalminae | — |
| Rondonops biscutatus | Rondonops | — |
| Rondonops xanthomystax | Rondonops | — |
| Roupala longepetiolata | Roupala | espécie vulnerável |
 Rudgea coronata | Rudgea | segura ou pouco preocupante |
| Rudgea reflexa | Rudgea | — |
| Ruizterania clavata | Ruizterania | dados insuficientes |
 Sagui-de-schneider | Mico | espécie ameaçada |
 Sagui-de-tufos-pretos | Callithrix | segura ou pouco preocupante |
| Saitis cyanipes | Saitis | — |
| Saitis marcusi | Saitis | — |
| Saitis nanus | Saitis | — |
 Salvator duseni | Salvator | segura ou pouco preocupante |