| Dendropsophus ruschii | Dendropsophus | segura ou pouco preocupante |
 Dendropsophus seniculus | Dendropsophus | segura ou pouco preocupante |
 Dendropsophus soaresi | Dendropsophus | segura ou pouco preocupante |
 Dendropsophus walfordi | Dendropsophus | segura ou pouco preocupante |
 Dendropsophus werneri | Dendropsophus | segura ou pouco preocupante |
| Dermochrosia maculatissima | Dermochrosia | — |
| Descanso vagus | Descanso | — |
| Diagondas viridiaureus | Diagondas | — |
| Dichaea mosenii | Dichaea | — |
| Dicymbe arenicola | Dicymbe | espécie ameaçada |
| Dicymbe puncticulosa | Dicymbe | espécie ameaçada |
| Diospyros akaraiensis | Diospyros | dados insuficientes |
 Diploglossus lessonae | Diploglossus | segura ou pouco preocupante |
| Diplopterys cachimbensis | Diplopterys | — |
| Diplura annectens | Diplura | — |
| Diplura catharinensis | Diplura | — |
| Diplura garbei | Diplura | — |
| Diplura maculata | Diplura | — |
| Diplura nigra | Diplura | — |
 Diplura sanguinea | Diplura | — |
| Diplura studiosa | Diplura | — |
| Diplura taunayi | Diplura | — |
| Dipoena ira | Dipoena | — |
| Dipoena niteroi | Dipoena | — |
| Dipoena santacatarinae | Dipoena | — |
| Dipsas alternans | Dipsas | segura ou pouco preocupante |
| Dipsas neivai | Dipsas | — |
| Dipsas sazimai | Dipsas | segura ou pouco preocupante |
| Ditaxodon taeniatus | Ditaxodon | espécie vulnerável |
| Drosera riparia | Drosera | — |
| Drosera schwackei | Drosera | — |
 Drosera spiralis | Drosera | — |
| Drosera spirocalyx | Drosera | — |
| Dryadella susanae | Dryadella | — |
 Dryadosaura nordestina | Dryadosaura | segura ou pouco preocupante |
 Drymoluber brazili | Drymoluber | segura ou pouco preocupante |
 Drymoreomys | Cricetidae | — |
 Dryophylax almae | Dryophylax | segura ou pouco preocupante |
| Dyrines brescoviti | Dyrines | — |
| Echinanthera amoena | Echinanthera | segura ou pouco preocupante |
 Echinanthera cephalomaculata | Echinanthera | espécie em perigo crítico |
| Echinanthera cephalostriata | Echinanthera | segura ou pouco preocupante |
| Echinanthera melanostigma | Echinanthera | segura ou pouco preocupante |
 Echinanthera undulata | Echinanthera | segura ou pouco preocupante |
| Ecpleopus gaudichaudii | Ecpleopus | segura ou pouco preocupante |
| Edwardsya | Salticidae | — |
 Egeria najas | Egeria | — |
| Elachistocleis carvalhoi | Elachistocleis | segura ou pouco preocupante |