 Reserva Biológica do Gurupi | Reserva Biológica | Centro Novo do Maranhão | 2.712 km² |
| Floresta Nacional de Purus | Floresta Nacional | Amazonas | 2.561 km² |
| Floresta Nacional do Purús | Floresta Nacional | — | 2.561 km² |
| Floresta Nacional de Macauã | Floresta Nacional | Acre | 1.764 km² |
| Floresta Nacional do Macauã | Floresta Nacional | — | 1.764 km² |
| Floresta Nacional de Bom Futuro | Floresta Nacional | Rondônia | 1.001 km² |
| Floresta Nacional do Bom Futuro | Floresta Nacional | — | 984 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Cafuringa | Área de Proteção Ambiental | Brasília | 465 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Marituba do Peixe | Área de Proteção Ambiental | Piaçabuçu | 185 km² |
 Parque Nacional Marinho de Fernando de Noronha | parque nacional | Fernando de Noronha | 113 km² |
| Apa da Pedra Branca | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 53,9 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Pedra Branca | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 53,9 km² |
 Reserva Biológica de Santa Isabel | Reserva Biológica | Pacatuba | 22,9 km² |
 Parque Natural Municipal das Dunas da Lagoa da Conceição | parque natural municipal | Florianópolis | 7,32 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Orla Marítima da Baía de Sepetiba | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 6,74 km² |
| Reserva Biológica do Gama | Reserva Biológica | Brasília | 5,37 km² |
| Reserva Biológica do Guará | Reserva Biológica | distrito federal | 5,37 km² |
 Floresta Nacional de Ibirama | Floresta Nacional | Apiúna | 5,19 km² |
| Arie Santuário de Vida Silvestre do Riacho Fundo | Área de Relevante Interesse Ecológico | Brasília | 4,77 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Santuário de Vida Silvestre do Riacho Fundo | Área de Relevante Interesse Ecológico | distrito federal | 4,77 km² |
| Floresta Estadual Metropolitana | floresta etadual | — | 4,59 km² |
| Floresta Estadual Metropolitana | floresta estadual | Paraná | 4,59 km² |
| Parque Natural Municipal da Cachoeira da Fumaça e Jacuba Parfumaça | área protegida | Resende | 3,63 km² |
| Apa da Orla Marítima | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 2,68 km² |
 Parque Natural Municipal da Serra de São Domingos | patrimônio natural | Poços de Caldas | 2,49 km² |
| Monumento Natural Morro Chico Mendes | monumento natural | Ouro Preto do Oeste | 1,65 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Orla Marítima | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 1,62 km² |
| Parque Estadual da Baleia | parque estadual | Belo Horizonte | 1,07 km² |
 Monumento Natural do Itabira | área protegida do Brasil | Cachoeiro de Itapemirim | 0,91 km² |
| Parque Natural Municipal Elci Rolla Guerra | parque natural | São Domingos do Prata | 0,49 km² |
| Arie Paranoá Sul | Área de Relevante Interesse Ecológico | Brasília | 0,40 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Paranoá Sul | Área de Relevante Interesse Ecológico | Distrito Federal | 0,40 km² |
 Parque Natural Municipal Gruta da Onça | parque natural municipal | Espírito Santo | 0,37 km² |
| Área de Proteção Ambiental Morro de São Bento | Área de Proteção Ambiental | Ribeirão Preto | 0,34 km² |
 Estação Ecológica da Universidade Federal de Minas Gerais | Estação Ecológica | Belo Horizonte | — |
| Parque Natural Municipal do Rio Pombo | parque natural | Rio de Janeiro | — |