 Estação Ecológica da Terra do Meio | Estação Ecológica | Uruará | 33.731 km² |
| Floresta Nacional de Balata-Tufari | Floresta Nacional | Canutama | 10.800 km² |
| Parque Estadual Sucunduri | parque estadual | Apuí | 7.962 km² |
| Floresta Estadual Sucunduri | floresta etadual | — | 4.811 km² |
| Floresta Estadual Sucunduri | floresta estadual | Amazonas | 4.811 km² |
 Parque Nacional da Serra do Pardo | parque nacional | Altamira | 4.454 km² |
 Capivara-Confusões Ecological Corridor | área protegida do Brasil | Piauí | 4.120 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Bacias do Rio Aporé e do Rio Sucuriu | Área de Proteção Ambiental | Chapadão do Sul | 3.850 km² |
| Reserva Biológica Nascentes da Serra do Cachimbo | Reserva Biológica | — | 3.422 km² |
| Reserva Biológica Nascentes Serra do Cachimbo | Reserva Biológica | Altamira | 3.421 km² |
| Floresta Estadual Aripuanã | floresta etadual | — | 3.287 km² |
| Floresta Estadual Aripuanã | floresta estadual | Amazonas | 3.287 km² |
| Reserva Extrativista Riozinho da Liberdade | Reserva Extrativista | Porto Walter | 3.249 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Nascente do Rio Sucuriú | Área de Proteção Ambiental | Costa Rica | 2.943 km² |
| Floresta Nacional de Anauá | Floresta Nacional | Rorainópolis | 2.594 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Rio Amapá | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Amazonas | 2.143 km² |
| Floresta Estadual Apuí | floresta etadual | — | 1.828 km² |
| Floresta Estadual Apuí | floresta estadual | Amazonas | 1.828 km² |
 Parque Nacional da Chapada das Mesas | parque nacional | Estreito | 1.600 km² |
| Área de Proteção Ambiental dos Mananciais Superficiais das Nascentes do Rio Apa | Área de Proteção Ambiental | Bela Vista | 1.516 km² |
| Reserva Extrativista do Guariba | Reserva Extrativista | Apuí | 1.481 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Bararati | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Apuí | 1.108 km² |
| Reserva Extrativista Mapuá | Reserva Extrativista | Porto de Moz | 938 km² |
| Reserva Extrativista Arióca Pruanã | Reserva Extrativista | Oeiras do Pará | 838 km² |
| Floresta Estadual Manicoré | floresta etadual | — | 835 km² |
| Floresta Estadual Manicoré | floresta estadual | Amazonas | 835 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Gurupi-Piriá | Reserva Extrativista Marinha | Pará | 728 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Gurupi-piriá | Reserva Extrativista | Viseu | 728 km² |
| Parque Estadual Guariba | parque estadual | Manicoré | 711 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável de Itatupã-baquiá | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | — | 644 km² |
 Reserva de Desenvolvimento Sustentável Itatupã-Baquiá | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Pará | 644 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Araí-peroba | Reserva Extrativista | Augusto Corrêa | 626 km² |
| Reserva Extrativista Ipaú-Anilzinho | Reserva Extrativista | Baião | 558 km² |
| Reserva Extrativista Marinha Caeté-taperaçu | Reserva Extrativista | Bragança | 425 km² |
| Reserva Extrativista Marinha Arai-Peroba | Reserva Extrativista Marinha | Pará | 399 km² |
| Área de Proteção Ambiental Igarapé São Francisco | Área de Proteção Ambiental | Bujari | 300 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Tracuateua | Reserva Extrativista | Tracuateua | 279 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Canumã | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Borba | 228 km² |
 Área de Proteção Ambiental Estadual Delta do Jacuí | Área de Proteção Ambiental | Charqueadas | 228 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Aripuanã | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Apuí | 225 km² |
 Parque Estadual da Serra do Cabral | parque estadual | Joaquim Felício | 224 km² |
| Reserva Extrativista Marinha Caetétaperaçu | Reserva Extrativista Marinha | Pará | 164 km² |
 Parque Nacional das Araucárias | parque nacional | Passos Maia | 128 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável do Tupé | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Manaus | 122 km² |
| Apa Nascente do Rio Amambai | Área de Proteção Ambiental | — | 94,5 km² |
 Reserva Extrativista Marinha Tracuateua | Reserva Extrativista Marinha | Pará | 91,6 km² |
 Parque Nacional da Serra de Itabaiana | parque nacional | Sergipe | 80,2 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Gericinó/Mendanha | Área de Proteção Ambiental | Mesquita | 79,7 km² |
| Estação Ecológica da Mata Preta | Estação Ecológica | — | 65,7 km² |
 Estação Ecológica de Mata Preta | Estação Ecológica | Paraná | 65,7 km² |
 Parque Estadual Acarai | parque estadual | São Francisco do Sul | 64,5 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Porto Cajueiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 61,9 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Uacarí | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Carauari | 58,2 km² |
| Área de Proteção Ambiental Lago do Amapá | Área de Proteção Ambiental | Rio Branco | 51,8 km² |
| Estação Ecológica do Rio Preto | Estação Ecológica | Santa Rita de Cássia | 48,8 km² |
 Parque Estadual Quarta Colônia | parque estadual | Ibarama | 18,5 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Parque do Capetinga | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São João d'Aliança | 15,8 km² |
| Área de Proteção Ambiental Floresta do Cafundó | Área de Proteção Ambiental | — | 11,1 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rumo Ao Oeste | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Corumbá | 9,49 km² |
| Área de Proteção Ambiental Raimundo Irineu Serra | Área de Proteção Ambiental | Rio Branco | 9,08 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva do Muquém | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 7,18 km² |
| Parque Natural Municipal Banhado da Imperatriz | parque natural | São Leopoldo | 6,76 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Brumas do Espinhaço | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 6,70 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Capitão | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 6,60 km² |
 Parque Natural Municipal do Espalhado | parque natural municipal | Ibicoara | 6,12 km² |
| Área de Proteção Ambiental Pontal/periperi | Área de Proteção Ambiental | — | 5,75 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Morro da Vargem | Área de Relevante Interesse Ecológico | Ibiraçu | 5,74 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mata São José | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 5,22 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Bosco | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Alegre dos Parecis | 4,87 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Lagoa Verde | Área de Proteção Ambiental | Rio Grande | 4,71 km² |
 Reserva Biológica Tamboré | Reserva Biológica | Santana de Parnaíba | 3,67 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Darcet Batalha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 3,06 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Arara Vermelha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Arinos | 2,54 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale dos Cristais | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 2,49 km² |
| Parque Natural Municipal João José Theodoro da Costa Neto | parque natural | Lages | 2,34 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Itabiruçu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 2,21 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Diogo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 1,95 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Graziela Maciel Barroso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Petrópolis | 1,85 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Arizona | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Vitória | 1,79 km² |
 Floresta Nacional de Palmares | Floresta Nacional | Teresina | 1,60 km² |
| Reserva Biológica do Rio Descoberto | Reserva Biológica | Brasília | 1,57 km² |
| Floresta Nacional do Ibura | Floresta Nacional | Nossa Senhora do Socorro | 1,44 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Ilha dos Lobos | refúgio de vida silvestre | Rio Grande do Sul | 1,42 km² |
| Parque Estadual Mata do Pau Ferro | parque estadual | Areia | 1,38 km² |
 Parque Estadual do Sítio do Rangedor | parque estadual | São Luís | 1,21 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Ecológica | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 1,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cachoeira das Pedras Bonitas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Colinas do Sul | 0,93 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico- Ilhas do Rio Paraiba do Sul | Área de Relevante Interesse Ecológico | Barra Mansa | 0,83 km² |
 Monumento Natural Estadual Peter Lund | monumento natural | Cordisburgo | 0,73 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Soluar | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,44 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cava II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Barretos | 0,41 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio das Antas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,35 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vila Amanda | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Paraopeba | 0,34 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale das Araras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,32 km² |
| Área de Proteção Ambiental Parque Municipal da Estância Ecológica do Cruzeiro | Área de Proteção Ambiental | Mariana | 0,28 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Laerth Paiva Gama | Área de Relevante Interesse Ecológico | Alegre | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Klagesi | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santo Antônio do Tauá | 0,23 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Córrego da Onça | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Carmo de Minas | 0,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio das Lontras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Catarina | 0,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Recanto dos Sonhos | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,17 km² |
| Arie de Horto D'el Rey | Área de Relevante Interesse Ecológico | Olinda | 0,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Capão Redondo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Balneário Arroio do Silva | 0,14 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico de Horto D'El Rey | Área de Relevante Interesse Ecológico | Pernambuco | 0,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Ponte Funda | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Farroupilha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Viamão | 0,10 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda do Tanque | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,10 km² |
| Parque Estadual do Descoberto | parque estadual | Goiás | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Células Verdes | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Baependi | 0,06 km² |
| Arie Mangue de Santa Teresa | Área de Relevante Interesse Ecológico | Olinda | 0,05 km² |
 Parque Natural Municipal das Andorinhas | parque natural | Ouro Preto | 0,05 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Mangue de Santa Teresa | Área de Relevante Interesse Ecológico | Pernambuco | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Varanda da Serra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cavalcante | 0,01 km² |
| Apuí State Forest | área protegida do Brasil | Amazonas | — |
| Aripuanã State Forest | área protegida do Brasil | — | — |
| Aripuanã Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | — | — |
| Bararati Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | — | — |
 Cisalpina Private Natural Heritage Reserve | área protegida do Brasil | — | — |
| Guariba State Park | área protegida do Brasil | — | — |
| Sucunduri State Forest | área protegida do Brasil | Amazonas | — |
| Sucunduri State Park | área protegida do Brasil | Amazonas | — |
| Tupé Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | Amazonas | — |
 Uacari Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | Amazonas | — |