 Terra Indígena do Vale do Javari | terra indígena no Brasil | Amazonas | 85.445 km² |
| Área de Proteção Ambiental Tapuruquara | Área de Proteção Ambiental | Santa Isabel do Rio Negro | 30.425 km² |
| Floresta Nacional de Pau-Rosa | Floresta Nacional | Borba | 9.846 km² |
| Área de Proteção Ambiental Pouso Alto | Área de Proteção Ambiental | Cavalcante | 8.395 km² |
 Estação Ecologica Serra Geral do Tocantins | Estação Ecológica | Formosa do Rio Preto | 7.071 km² |
| Parque Nacional da Serra da Cutia | parque nacional | Rondônia | 2.835 km² |
| Parque Nacional Serra da Cutia | parque nacional | — | 2.835 km² |
| Floresta Nacional de Santa Rosa do Purus | Floresta Nacional | Santa Rosa do Purus | 2.315 km² |
| Floresta Nacional de Mulata | Floresta Nacional | Alenquer | 2.163 km² |
| Estação Ecológica de Cuniã | Estação Ecológica | Humaitá | 1.854 km² |
| Reserva Extrativista Baixo Juruá | Reserva Extrativista | Amazonas | 1.780 km² |
| Reserva Extrativista do Baixo Juruá | Reserva Extrativista | — | 1.766 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Nascentes do Rio Vermelho | Área de Proteção Ambiental | Jaborandi | 1.763 km² |
 Parque Estadual do Jalapão | parque estadual | Mateiros | 1.590 km² |
| Reserva Extrativista Auatí-Paraná | Reserva Extrativista | Fonte Boa | 1.469 km² |
 Área de Proteção Ambiental dos Recifes de Corais | Área de Proteção Ambiental | Touros | 1.362 km² |
| Área de Proteção Ambiental Rio Batalha | Área de Proteção Ambiental | Duartina | 1.340 km² |
| Reserva Extrativista Barreiro das Antas | Reserva Extrativista | Guajará-Mirim | 1.061 km² |
 Parque Estadual do Xingu | parque estadual | Santa Cruz do Xingu | 953 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Quelônios do Araguaia | refúgio de vida silvestre | Cocalinho | 789 km² |
| Reserva Extrativista do Rio Cautário | Reserva Extrativista | Rondônia | 751 km² |
| Reserva Extrativista do Rio do Cautário | Reserva Extrativista | — | 751 km² |
 Área de Proteção Ambiental Serra Branca / Raso da Catarina | Área de Proteção Ambiental | Jeremoabo | 673 km² |
| Área de Proteção Ambiental Paytuna | Área de Proteção Ambiental | Monte Alegre | 574 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Bacia do Córrego Ceroula - Apa do Ceroula | Área de Proteção Ambiental | Campo Grande | 565 km² |
| Apa Quebra-pé | Área de Proteção Ambiental | Monjolos | 402 km² |
 Área de Proteção Ambiental de Macaé de Cima | Área de Proteção Ambiental | Nova Friburgo | 350 km² |
 Reserva Extrativista Marinha de Soure | Reserva Extrativista Marinha | Pará | 296 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Soure | Reserva Extrativista | Soure | 296 km² |
 Área de Proteção Ambiental Municipal do Capivari-Monos | Área de Proteção Ambiental | São Paulo | 251 km² |
 Parque Nacional de Saint-Hilaire/Lange | parque nacional | Morretes | 244 km² |
 Área de Proteção Ambiental de Campinas | Área de Proteção Ambiental | São Paulo | 223 km² |
| Floresta Nacional de São Francisco | Floresta Nacional | Sena Madureira | 211 km² |
| Floresta Nacional de Cristópolis | Floresta Nacional | Baianópolis | 128 km² |
 Estação Ecológica do Castanhão | Estação Ecológica | Jaguaribara | 126 km² |
| Estação Ecológica de Aiuaba | Estação Ecológica | Aiuaba | 117 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Sana | Área de Proteção Ambiental | Macaé | 110 km² |
 Parque Estadual do Lajeado | parque estadual | Palmas | 108 km² |
| Área de Proteção Ambiental Corredeiras | Área de Proteção Ambiental | Taparuba | 108 km² |
| Reserva Extrativista Marinha da Lagoa do Jequiá | Reserva Extrativista | Jequiá da Praia | 102 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Boqueirão da Mira | Área de Proteção Ambiental | Santa Rita de Jacutinga | 85,4 km² |
| Reserva Particular do Patrimonio Natural Fazenda Rio Negro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Aquidauana | 70,0 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Corixão da Mata Azul | refúgio de vida silvestre | Novo Santo Antônio | 62,5 km² |
| Estação Ecológica de Murici | Estação Ecológica | Messias | 61,3 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Itacuru | Área de Proteção Ambiental | Itambé do Mato Dentro | 55,7 km² |
| Área de Proteção Ambiental dos Mananciais do Córrego Lajeado - Apa do Lajeado | Área de Proteção Ambiental | Campo Grande | 52,3 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Iguaçu I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Quedas do Iguaçu | 51,5 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Nascentes do Rio de Contas | Área de Relevante Interesse Ecológico | Abaíra | 47,7 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Nascente do Rio de Contas | Área de Relevante Interesse Ecológico | Bahia | 47,6 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Caetezal | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Catarina | 46,1 km² |
| Parque Estadual de Monte Alegre | parque estadual | Monte Alegre | 36,1 km² |
 Reserva Extrativista Marinha da Lagoa do Jequiá | Reserva Extrativista Marinha | Alagoas | 27,1 km² |
| Área de Proteção Ambiental Pedra do Elefante | Área de Proteção Ambiental | Nova Venécia | 25,6 km² |
| Parque Estadual do Araguaiaa | parque estadual | Novo Santo Antônio | 23,4 km² |
| Aréa de Proteção Ambiental de Ribeirãozinho e Alcantilado do Rio Araguaia | Área de Proteção Ambiental | Ribeirãozinho | 21,7 km² |
| Estação Ecológica do Rio dos Touros | Estação Ecológica | — | 12,2 km² |
| Estação Ecológica Rio dos Touros | Estação Ecológica | Paraná | 12,2 km² |
| Área de Proteção Ambiental Bacia do Cobre / São Bartolomeu | Área de Proteção Ambiental | Salvador | 11,7 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Guará | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cocos | 10,5 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Parque Natural Leonildo Ferreira 1 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pimenta Bueno | 9,95 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Parque Natural Leonildo Ferreira 2 | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pimenta Bueno | 9,81 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Floresta Negra | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Sete Quedas | 9,71 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Feliciano Miguel Abdala | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Caratinga | 9,58 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Tupaquiri | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Boa Vista | 8,83 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Capão Bonito | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mato Grosso do Sul | 6,84 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Guara I e II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cocos | 6,33 km² |
| Estação Ecológica Fernandes Pinheiro | Estação Ecológica | Fernandes Pinheiro | 5,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lagoa do Formoso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Cocos | 5,02 km² |
| Área de Proteção Ambiental Fazenda Capitão Eduardo | Área de Proteção Ambiental | Minas Gerais | 4,89 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Rio Bonito | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Quixeramobim | 4,41 km² |
 Parque Municipal Natural da Boa Esperança | parque natural | Ilhéus | 4,27 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Chácara Edith | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Brusque | 4,16 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Floresta Alta | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 3,81 km² |
| Parque Natural Municipal do Córrego Cumandaí | parque natural | Naviraí | 3,71 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Amoreira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rosário | 3,49 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Dunas de Santo Antônio | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mata de São João | 3,33 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Monte Alegre | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pacatuba | 2,63 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Palmira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Serra Azul | 2,42 km² |
| Monumento Natural Cachoeira do Amâncio | monumento natural | Biguaçu | 2,39 km² |
 Monumento Natural da Gruta do Lago Azul | monumento natural | Bonito | 2,39 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural do Pereira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alagoas | 2,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Caroá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 2,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Pereira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Coruripe | 2,16 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Santa Mônica | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Corumbá de Goiás | 2,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Major Badú Loureiro | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Catingueira | 1,86 km² |
 Floresta Nacional de Nísia Floresta | Floresta Nacional | Nísia Floresta | 1,69 km² |
| Apa do Morro do Valqueire | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 1,66 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Morro do Valqueire | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 1,66 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural São Francisco da Trijunção | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bahia | 1,62 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda das Palmas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio Grande do Sul | 1,60 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Córrego das Traíras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Crisólita | 1,59 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Meandros II | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ibiúna | 1,45 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda São Benedito | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Rio Claro | 1,44 km² |
| Floresta Estadual São Judas Tadeu | floresta estadual | Minas Gerais | 1,41 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Ecológica Serra Dourada | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Trombas | 1,37 km² |
| Parque Estadual Cristalino II | parque estadual | Novo Mundo | 1,34 km² |
| Parque Natural Municipal de Grumari | parque natural | Rio de Janeiro | 1,27 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural apa da Lagoa | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Planaltina | 1,25 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Gaviões | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Silva Jardim | 1,17 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Bela Vista - To | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Tocantins | 1,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Meandros | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ibiúna | 1,11 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Portal do Pantanal I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Miranda | 1,11 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Santa Tereza | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Atalaia | 1,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Prima Luna | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Nova Trento | 1 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Comodato Reserva de Peti | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Gonçalo do Rio Abaixo | 0,96 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Olga Coelho Ulman | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,92 km² |
| Parque Natural Municipal de São Gonçalo | parque natural | São Gonçalo | 0,89 km² |
 Reserva Particular do Patrimônio Natural Ano Bom | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Catarina | 0,88 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Mato Grosso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Saquarema | 0,84 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Escarpas do Paraíso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 0,83 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lafarge | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,83 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Meandros III | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Ibiúna | 0,73 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lula Lobo I | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Coruripe | 0,69 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Betel | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Amazonas | 0,68 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Dr. Phelippe Daou | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Presidente Figueiredo | 0,65 km² |
| Reserva Biológica das Capivaras | Reserva Biológica | Mato Grosso do Sul | 0,64 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vale dos Sonhos | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 0,60 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sesc Tepequém | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Boa Vista | 0,55 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Portal Curupira | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 0,50 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda San Michele | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São José dos Campos | 0,41 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Gulandim | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Teotônio Vilela | 0,41 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Panelão dos Muriques | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Fervedouro | 0,40 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Terra do Segredo | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 0,40 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cachoeira do Cerradão | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,38 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Estância Pedreiras | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Luís | 0,38 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Lagoa do Peixe | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Caravelas | 0,31 km² |
| Parque Natural Municipal da Grota de Mirassol | parque natural | Mirassol | 0,29 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Ecológica Cachoeira das Andorinhas | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Aporé | 0,29 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Cabeceira das Flores | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Paineiras | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Centro de Vivência Com A Natureza - Cvn | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Araçoiaba da Serra | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Sayonara | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Conceição da Barra | 0,28 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural do Guaxinim | Reserva Particular do Patrimônio Natural | — | 0,26 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Santa Beatriz do Carnijó | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Moreno | 0,26 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva do Patrimônio Natural do Guaxinim | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Santa Catarina | 0,26 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva dos Arqueiros | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Amazonas | 0,25 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva dos Quatro Elementos | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Presidente Figueiredo | 0,25 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Vita Parque | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 0,23 km² |
| RPPN Vita Parque | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Alto Paraíso de Goiás | 0,23 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pedra do Sabiá | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Itacaré | 0,22 km² |
| Arie do Bosque | Área de Relevante Interesse Ecológico | Brasília | 0,20 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Sol Nascente | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Presidente Figueiredo | 0,20 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico do Bosque | Área de Relevante Interesse Ecológico | distrito federal | 0,20 km² |
| Área de Relevante Interesse Ecológico Lagoa Azul | Área de Relevante Interesse Ecológico | Distrito Federal | 0,20 km² |
| Parque Natural Municipal da Lage | parque natural municipal | — | 0,16 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural da Pedra Branca | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Serrinha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Bragança Paulista | 0,15 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Bom Sucesso | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Goianápolis | 0,14 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Agda | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Pojuca | 0,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda Boa Esperança | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,13 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Parque Arqueológico da Serra do Santo Antônio | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Andrelândia | 0,09 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Fazenda São Lourenço/Matinha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,08 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural da Mata Atlântica da Manona | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Seguro | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Floresta Negra, Parque Natural Para Estudos, Pesquisa e Educação Ambiental | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Araçoiaba da Serra | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Morada do Sol e da Lua | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Presidente Figueiredo | 0,07 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Capuavinha | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Mairiporã | 0,05 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural São Francisco de Assis | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,04 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Som e Poesia | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,04 km² |
| Parque Natural Municipal do Jardim do Carmo | parque natural | Vila Kosmos | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Reserva Córrego da Aurora | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Brasília | 0,03 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Instituto Olho D'Água | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Jardim da Paz | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Porto Alegre | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio do Jacu | Reserva Particular do Patrimônio Natural | São Paulo | 0,02 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Josepha Mendes Ferrão | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Pé da Laje | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,01 km² |
| Reserva Particular do Patrimônio Natural Sítio Ventania | Reserva Particular do Patrimônio Natural | Minas Gerais | 0,01 km² |
| Cristalino II State Park | área protegida do Brasil | — | — |
| Lagoa do Frio Municipal Nature Park | área protegida do Brasil | — | — |
| Monte Alegre State Park | área protegida do Brasil | Monte Alegre | — |
| Pau-Rosa National Forest | área protegida do Brasil | Amazonas | — |
 Reserva Extrativista Federal do Rio Cautário | área protegida do Brasil | — | — |
| Restinga Municipal Nature Park | área protegida do Brasil | — | — |
| Rio Perequê Municipal Nature Park | área protegida do Brasil | — | — |
| Santa Maria Ecological Corridor | área protegida do Brasil | — | — |
| Santa Rosa do Purus National Forest | área protegida do Brasil | — | — |
| São Francisco National Forest | área protegida do Brasil | — | — |
| Urariá Sustainable Development Reserve | área protegida do Brasil | Amazonas | — |