| Reserva Extrativista Terra Grande-pracuúba | Reserva Extrativista | — | 1.949 km² |
| Reserva Extrativista Arapiranga-Tromaí | Reserva Extrativista | Luís Domingues | 1.869 km² |
| Estação Ecológica de Cuniã | Estação Ecológica | Humaitá | 1.854 km² |
| Reserva Extrativista de Cururupu | Reserva Extrativista | Apicum-Açu | 1.852 km² |
| Reserva Extrativista do Rio Ouro Preto | Reserva Extrativista | — | 1.840 km² |
| Floresta Estadual Apuí | floresta etadual | — | 1.828 km² |
| Floresta Estadual Apuí | floresta estadual | Amazonas | 1.828 km² |
 Área de Proteção Ambiental Fernão Dias | Área de Proteção Ambiental | Minas Gerais | 1.822 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Campina | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Rorainópolis | 1.802 km² |
| Estação Ecológica Soldado da Borracha | Estação Ecológica | Porto Velho | 1.791 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Bacia do Rio Iguatemi do Município de Tacuru | Área de Proteção Ambiental | Tacuru | 1.785 km² |
| Reserva Extrativista Baixo Juruá | Reserva Extrativista | Amazonas | 1.780 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável do Matupiri | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Amazonas | 1.770 km² |
| Reserva Extrativista do Baixo Juruá | Reserva Extrativista | — | 1.766 km² |
| Floresta Nacional de Macauã | Floresta Nacional | Acre | 1.764 km² |
| Floresta Nacional do Macauã | Floresta Nacional | — | 1.764 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Nascentes do Rio Vermelho | Área de Proteção Ambiental | Jaborandi | 1.763 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado do Rio Machado | floresta etadual | — | 1.758 km² |
| Floresta Estadual de Rendimento Sustentado do Rio Machado | floresta estadual | Rondônia | 1.758 km² |
 Área de Proteção Ambiental Estadual Guaraqueçaba | Área de Proteção Ambiental | Pontal do Paraná | 1.741 km² |
 Parque Nacional do Iguaçu | patrimônio natural | Matelândia | 1.697 km² |
| Floresta Nacional de Roraima | Floresta Nacional | Mucajaí | 1.696 km² |
 Área de Proteção Ambiental Sul-RMBH | Área de Proteção Ambiental | Barão de Cocais | 1.644 km² |
 Parque Nacional da Chapada das Mesas | parque nacional | Estreito | 1.600 km² |
 Parque Estadual do Jalapão | parque estadual | Mateiros | 1.590 km² |
 Parque Estadual Serra Ricardo Franco | parque estadual | Vila Bela da Santíssima Trindade | 1.569 km² |
 Parque Nacional dos Lençóis Maranhenses | patrimônio natural | Primeira Cruz | 1.566 km² |
 Área de Proteção Ambiental de Fernando de Noronha | Área de Proteção Ambiental | Pernambuco | 1.544 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Fernando de Noronha - Rocas - São Pedro e São Paulo | Área de Proteção Ambiental | — | 1.544 km² |
| Reserva Extrativista Alto Tarauacá | Reserva Extrativista | Acre | 1.541 km² |
| Reserva Extrativista do Alto Tarauacá | Reserva Extrativista | — | 1.541 km² |
| Área de Proteção Ambiental dos Campos de Manicoré | Área de Proteção Ambiental | Manicoré | 1.524 km² |
 Parque Nacional da Chapada Diamantina | museu | Mucugê | 1.521 km² |
| Área de Proteção Ambiental dos Mananciais Superficiais das Nascentes do Rio Apa | Área de Proteção Ambiental | Bela Vista | 1.516 km² |
| Floresta Estadual Canutama | floresta estadual | Canutama | 1.506 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Bacia do Rio São João - Mico-leão-dourado | Área de Proteção Ambiental | — | 1.504 km² |
 Reserva Extrativista Rio Cautário | Reserva Extrativista | Guajará-Mirim | 1.486 km² |
| Parque Estadual Rio Negro Setor Norte | parque estadual | Novo Airão | 1.481 km² |
| Reserva Extrativista do Guariba | Reserva Extrativista | Apuí | 1.481 km² |
| Reserva Extrativista Auatí-Paraná | Reserva Extrativista | Fonte Boa | 1.469 km² |
| Reserva Extrativista Gurupá-Melgaço | Reserva Extrativista | Gurupá | 1.454 km² |
 Área de Proteção Ambiental Litoral Norte | Área de Proteção Ambiental | Bahia | 1.447 km² |
| Floresta Estadual do Mogno | floresta etadual | — | 1.439 km² |
| Floresta Estadual do Mogno | floresta estadual | Acre | 1.439 km² |
| Área de Proteção Ambiental Corumbataí-Botucatu-Tejupá, Perimetro Tejupá | Área de Proteção Ambiental | São Paulo | 1.425 km² |
| Área de Proteção Ambiental Cuesta Parapanema | Área de Proteção Ambiental | Barão de Antonina | 1.425 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Bacia do Iguatemi no Município de Amambai | Área de Proteção Ambiental | Amambai | 1.411 km² |
| Floresta Nacional do Itacaiunas | Floresta Nacional | — | 1.398 km² |