| Reserva Extrativista Guariba-Roosevelt | Reserva Extrativista | Colniza | 1.377 km² |
| Reserva Extrativista Ilha do Tumba | Reserva Extrativista | Cananéia | 1.377 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Litoral Norte do Estado da Bahia | Área de Proteção Ambiental | Jandaíra | 1.372 km² |
| Floresta Nacional de Itacaiunas | Floresta Nacional | Pará | 1.367 km² |
 Área de Proteção Ambiental dos Recifes de Corais | Área de Proteção Ambiental | Touros | 1.362 km² |
 Parque Nacional do Pantanal Matogrossense | parque nacional | Poconé | 1.356 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Sub-bacia do Rio Aporé | Área de Proteção Ambiental | Cassilândia | 1.352 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Sub-Bacia do Rio Ivinhema | Área de Proteção Ambiental | Novo Horizonte do Sul | 1.352 km² |
| Estação Ecológica de Uruçuí-Una | Estação Ecológica | Baixa Grande do Ribeiro | 1.351 km² |
 Área de Proteção Ambiental Jalapão | Área de Proteção Ambiental | Ponte Alta do Tocantins | 1.350 km² |
| Área de Proteção Ambiental Rio Batalha | Área de Proteção Ambiental | Duartina | 1.340 km² |
| Reserva Extrativista Arapixi | Reserva Extrativista | Boca do Acre | 1.337 km² |
 Área de Proteção Ambiental Morro da Pedreira | Área de Proteção Ambiental | Itabira | 1.318 km² |
 Parque Nacional das Emas | Parque Nacional do Brasil | Mineiros | 1.314 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Bacia do Rio Iguatemi no Município de Paranhos | Área de Proteção Ambiental | Paranhos | 1.300 km² |
 Parque Nacional da Serra da Capivara | patrimônio natural | São Raimundo Nonato | 1.291 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre das Veredas do Oeste Baiano | refúgio de vida silvestre | Bahia | 1.281 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Veredas do Oeste Baiano | refúgio de vida silvestre | Bahia | 1.280 km² |
| Parque Nacional das Sempre-vivas | parque nacional | — | 1.266 km² |
| Estação Ecológica Mamuru | Estação Ecológica | Juruti | 1.264 km² |
| Floresta Estadudal do Rio Liberdade | floresta etadual | — | 1.264 km² |
| Floresta Estadudal do Rio Liberdade | floresta estadual | Acre | 1.264 km² |
 Área de Proteção Ambiental Marimbus / Iraquara | Área de Proteção Ambiental | Palmeiras | 1.249 km² |
 Área de Proteção Ambiental Baía de Todos os Santos | Área de Proteção Ambiental | Simões Filho | 1.246 km² |
 Parque Nacional das Sempre Vivas | parque nacional | Minas Gerais | 1.241 km² |
 Área de Proteção Ambiental Baía de Camamu | Área de Proteção Ambiental | Itacaré | 1.222 km² |
| Parque Estadual Serra Santa Bárbara | parque estadual | Porto Esperidião | 1.204 km² |
| Área de Proteção Ambiental dos Altos Cursos dos Rios Gurgueia e Uruçuí-vermelho | Área de Proteção Ambiental | Gilbués | 1.199 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Bacia Hidrográfica do Rio Machado | Área de Proteção Ambiental | Congonhal | 1.174 km² |
 Área de Proteção Ambiental de Muricí | Área de Proteção Ambiental | Colônia Leopoldina | 1.161 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Bacia do Rio Iguatemi no Município de Iguatemi | Área de Proteção Ambiental | Iguatemi | 1.154 km² |
 Parque Nacional do Monte Roraima | parque nacional | Uiramutã | 1.151 km² |
 Área de Proteção Ambiental Costa das Algas | Área de Proteção Ambiental | Aracruz | 1.143 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Rio Pardo | Área de Proteção Ambiental | Porto Velho | 1.138 km² |
 Área de Proteção Ambiental Serra do Lajeado | Área de Proteção Ambiental | Tocantínia | 1.119 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Sub Bacia do Rio Pardo | Área de Proteção Ambiental | — | 1.109 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Sub-bacia do Rio Pardo | Área de Proteção Ambiental | Mato Grosso do Sul | 1.109 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Bararati | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Apuí | 1.108 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre Tatu-Bola | refúgio de vida silvestre | Pernambuco | 1.101 km² |
| Floresta Nacional do Parima | Floresta Nacional | Amajari | 1.095 km² |
 Parque Estadual Encontro das Águas | parque estadual | Barão de Melgaço | 1.081 km² |
| Reserva Extrativista Barreiro das Antas | Reserva Extrativista | Guajará-Mirim | 1.061 km² |
| Estação Ecológica Raso da Catarina | Estação Ecológica | Paulo Afonso | 1.048 km² |
| Parque Estadual do Guirá | parque estadual | Cáceres | 1.046 km² |
 Área de Proteção Ambiental do Banhado Grande | Área de Proteção Ambiental | Gravataí | 1.045 km² |
| Estação Ecológica de Maracá | Estação Ecológica | Roraima | 1.035 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Serra da Caiçara | Área de Proteção Ambiental | Alagoas | 1.033 km² |
 Reserva de Desenvolvimento Sustentável do Rio Negro | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Novo Airão | 1.030 km² |