 Área de Proteção Ambiental Lago de Peixe/Angical | Área de Proteção Ambiental | Peixe | 755 km² |
| Área de Proteção Ambiental Municipal do Aricá-Açu | Área de Proteção Ambiental | Cuiabá | 754 km² |
| Reserva Extrativista do Rio Cautário | Reserva Extrativista | Rondônia | 751 km² |
| Reserva Extrativista do Rio do Cautário | Reserva Extrativista | — | 751 km² |
 Área de Proteção Ambiental do Rio Guandu | Área de Proteção Ambiental | Paracambi | 743 km² |
 Parque Estadual das Várzeas do Rio Ivinhema | parque estadual | Naviraí | 742 km² |
| Parque Estadual do Rio Turvo | parque estadual | Jacupiranga | 738 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serras e Brejos do Capibaribe | Área de Proteção Ambiental | Brejo da Madre de Deus | 738 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Gurupi-Piriá | Reserva Extrativista Marinha | Pará | 728 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Gurupi-piriá | Reserva Extrativista | Viseu | 728 km² |
 Área de Proteção Ambiental João Leite | Área de Proteção Ambiental | Anápolis | 713 km² |
| Parque Estadual Guariba | parque estadual | Manicoré | 711 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Nascentes do Rio Apa | Área de Proteção Ambiental | Ponta Porã | 709 km² |
| Área de Proteção Ambiental Nascentes do Rio Paraguai | Área de Proteção Ambiental | Alto Paraguai | 709 km² |
| Estação Ecológica Samuel | Estação Ecológica | Candeias do Jamari | 690 km² |
| Reserva Extrativista Municipal Beija Flor Brilho de Fogo | Reserva Extrativista | Pedra Branca do Amapari | 682 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Petrópolis | Área de Proteção Ambiental | Rio de Janeiro | 682 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serra do Barbado | Área de Proteção Ambiental | Bahia | 680 km² |
 Refúgio de Vida Silvestre do Arquipélago de Alcatrazes | refúgio de vida silvestre | São Sebastião | 675 km² |
| Refúgio de Vida Silvestre do Chaua | refúgio de vida silvestre | Cambuci | 675 km² |
 Área de Proteção Ambiental Serra Branca / Raso da Catarina | Área de Proteção Ambiental | Jeremoabo | 673 km² |
 Reserva de Marapendi | reserva florestal | Rio de Janeiro | 666 km² |
| Área de Proteção Ambiental Serras da Caatinga | Área de Proteção Ambiental | — | 664 km² |
| Área de Proteção Ambiental de Joanes - Ipitanga | Área de Proteção Ambiental | — | 663 km² |
 Parque Estadual Charapucu | parque estadual | Afuá | 653 km² |
 Parque Nacional da Chapada dos Veadeiros | parque nacional | Nova Roma | 647 km² |
 Área de Proteção Ambiental Quilombos do Médio Ribeira | ecorregião | Barra do Turvo | 647 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável de Itatupã-baquiá | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | — | 644 km² |
 Reserva de Desenvolvimento Sustentável Itatupã-Baquiá | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Pará | 644 km² |
| Área de Proteção Ambiental Ibitinga | Área de Proteção Ambiental | Ibitinga | 639 km² |
| Área de Proteção Ambiental Lago de Palmas | Área de Proteção Ambiental | Porto Nacional | 639 km² |
 Área de Proteção Ambiental da Serra do Barbado | Área de Proteção Ambiental | Rio de Contas | 637 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Boqueirão do Poti | Área de Proteção Ambiental | Poranga | 633 km² |
| Reserva Extrativista Marinha de Araí-peroba | Reserva Extrativista | Augusto Corrêa | 626 km² |
 Área de Proteção Ambiental Costa de Itacaré/ Serra Grande | Área de Proteção Ambiental | Uruçuca | 626 km² |
 Parque Nacional do Catimbau | parque nacional | Ibimirim | 623 km² |
 Parque Nacional da Serra do Teixeira | parque nacional | Santana dos Garrotes | 611 km² |
| Área de Proteção Ambiental das Nascentes do Rio Uruçuí-preto | Área de Proteção Ambiental | Monte Alegre do Piauí | 601 km² |
| Reserva Estadual de Desenvolvimento Sustentável Veredas do Acari | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | — | 591 km² |
 Parque Estadual Cristalino | parque estadual | Novo Mundo | 590 km² |
 Parque Estadual dos Três Picos | parque estadual | Cachoeiras de Macacu | 588 km² |
| Reserva de Desenvolvimento Sustentável Veredas do Acari | Reserva de Desenvolvimento Sustentável | Minas Gerais | 588 km² |
| Reserva Extrativista Angelim | Reserva Extrativista | Machadinho d'Oeste | 588 km² |
| Área de Proteção Ambiental da Região Serrana de Petrópolis | Área de Proteção Ambiental | Magé | 587 km² |
| Área de Proteção Ambiental do Rio Amambai | Área de Proteção Ambiental | Amambai | 585 km² |
| Floresta Estadual do Antimary | floresta etadual | — | 576 km² |
| Floresta Estadual do Antimary | floresta estadual | Acre | 576 km² |
| Estação Ecológica Umírizal | Estação Ecológica | Porto Velho | 575 km² |